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Enregistrement W4376112483 · doi:10.26434/chemrxiv-2023-qtzzd

Rapid Fluorescence EEM spectra acquisition using super-cycle Hadamard-Transform Multiplexing

2023· preprint· en· W4376112483 sur OpenAlexafffund
Travis Ferguson, Hans‐Peter Loock

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueSpectroscopy and Chemometric Analyses
Établissements canadiensUniversity of VictoriaQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaQueen's UniversityUniversity of Victoria
Mots-clésHadamard transformMultiplexingExcitationSpectral lineData acquisitionComputer scienceAlgorithmChemistryAnalytical Chemistry (journal)Biological systemMathematicsPhysicsTelecommunicationsMathematical analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hadamard-transform multiplexing has recently been applied to increasingly complex spectroscopic techniques. It had been shown that the data acquisition time for fluorescence Excitation-Emission-Matrix spectroscopy can be reduced by one or two orders of magnitude using Hadamard-Transform multiplexing of the excitation light using a programmable lightsource. In these previous studies, the data acquisition rate had been limited by the time it took to record an EEM, i.e. to complete one cycle of multiplexed excitation spectra. The extraction of chemical information, such as concentration and chemical identity, is then obtained from parallel factor (PARAFAC) analysis of the sequence of EEM spectra. In this contribution we increase the data acquisition rate by another order of magnitude, i.e. to the time it takes to record a single excitation spectrum. Our algorithm is entirely based on improved data processing, i.e. it can be applied to previously recorded Hadamard-Transform multiplexed data sets. The algorithm is based on three previously unexplored approaches: (1) we perform a PARAFAC multivariate analysis on the raw (multiplexed) data set (2) the PARAFAC loading vectors are obtained prior to obtaining the score vectors, (3) when loading vectors are difficult to obtain from the stack of EEM spectra, we instead use a rolling-average approach to considerably increase the number of spectra and the stability of the fit. Analysis of experimental data shows that fluorescence EEM spectra with 7 excitation wavelengths and over 1000 emission wavelengths can be obtained in less than 20 ms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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