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Enregistrement W4376130040 · doi:10.1101/2023.05.11.23289843

Viral and immune dynamics of HPV genital infections in young women

2023· preprint· en· W4376130040 sur OpenAlexaff
Nicolas Tessandier, Baptiste Elie, Vanina Boué, Christian P. Selinger, Massilva Rahmoun, Claire Bernat, Sophie Grasset, Soraya Groc, Anne‐Sophie Bedin, Thomas Bénéteau, Marine Bonneau, Christelle Graf, Nathalie Jacobs, Tsukushi Kamiya, Marion Kerioui, Julie Lajoie, Imène Melki, Jean‐Luc Prétet, Bastien Reyné, Géraldine Schlecht‐Louf, Mircea T. Sofonea, Olivier Supplisson, Vincent Foulongne, Jérémie Guedj, Christophe Hirtz, Marie‐Christine Picot, Jacques Reynes, Vincent Tribout, Édouard Tuaillon, Tim Waterboer, Michel Segondy, Ignacio G. Bravo, Nathalie Boulle, Carmen Lía Murall, Samuel Alizon

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueLigue Contre le CancerInstitut de Recherche pour le DéveloppementAgence Nationale de la RechercheEuropean CommissionStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésImmune systemViral loadImmunologyVaccinationHPV infectionCohortMedicineSex organVirologyBiologyCancerVirusCervical cancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human papillomavirus (HPV) infections drive one in twenty new cancer cases. Despite the potential for improving treatment, screening, and vaccination strategies, little is known as to why most HPV infections clear spontaneously within two years. To untangle the dynamics of these non-persisting infections, we performed a combined quantitative analysis of virological, immunological, and clinical data from an original longitudinal cohort of 189 women with high temporal resolution. We find that HPV viral load reaches a plateau within two months, and clears within a median time of 14 months. Furthermore, we identify immune correlates associated with infection clearance, especially TCR-gamma-delta cells. Our results open new perspectives for understanding the frontier between acute and chronic infections and for controlling HPVassociated diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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