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Enregistrement W4376140397 · doi:10.1002/ece3.9961

Reproducibility in ecology and evolution: Minimum standards for data and code

2023· article· en· W4376140397 sur OpenAlexaff
Gareth Jenkins, Andrew P. Beckerman, Céline Bellard, Ana Benítez‐López, Aaron M. Ellison, Christopher G. Foote, Andrew L. Hufton, Marcus A. Lashley, Christopher J. Lortie, Zhaoxue Ma, Allen J. Moore, Shawn R. Narum, Johan Nilsson, Bridget O’Boyle, Diogo B. Provete, Orly Razgour, Loren H. Rieseberg, Cynthia Riginos, Luca Santini, Benjamin Sibbett, Pedro R. Peres‐Neto

Notice bibliographique

RevueEcology and Evolution · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueResearch Data Management Practices
Établissements canadiensConcordia UniversityUniversity of British ColumbiaYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCommitComputer scienceData scienceCitationOpen scienceSimple (philosophy)Code (set theory)Open dataEcologyWorld Wide WebBiologyDatabaseProgramming languageEpistemologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We call for journals to commit to requiring open data be archived in a format that will be simple and clear for readers to understand and use. If applied consistently, these requirements will allow contributors to be acknowledged for their work through citation of open data, and facilitate scientific progress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,532
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,731
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,468
Score d'incertitude au seuil0,577

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,5320,731
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,006
Bibliométrie0,0210,020
Études des sciences et des technologies0,0100,019
Communication savante0,0310,027
Science ouverte0,0180,019
Intégrité de la recherche0,0140,025
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,023

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,102
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineReproductibilité
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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