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Enregistrement W4376150308 · doi:10.1101/2023.05.10.540244

Behavioral Classification of Sequential Neural Activity Using Time Varying Recurrent Neural Networks

2023· preprint· en· W4376150308 sur OpenAlexaff
Yongxu Zhang, Catalin Mitelut, David J. Arpin, David E. Vaillancourt, Timothy H. Murphy, Shreya Saxena

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésRecurrent neural networkComputer scienceArtificial intelligenceArtificial neural networkNeural decodingSequence (biology)Machine learningDecoding methodsPattern recognition (psychology)Algorithm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Shifts in data distribution across time can strongly affect early classification of time-series data. When decoding behavior from neural activity, early detection of behavior may help in devising corrective neural stimulation before the onset of behavior. Recurrent Neural Networks (RNNs) are common models for sequence data. However, standard RNNs are not able to handle data with temporal distributional shifts to guarantee robust classification across time. To enable the network to utilize all temporal features of the neural input data, and to enhance the memory of an RNN, we propose a novel approach: RNNs with time-varying weights, here termed Time-Varying RNNs (TV-RNNs). These models are able to not only predict the class of the time-sequence correctly but also lead to accurate classification earlier in the sequence than standard RNNs. In this work, we focus on early sequential classification of brain-wide neural activity across time using TV-RNNs applied to a variety of neural data from mice and humans, as subjects perform motor tasks. Finally, we explore the contribution of different brain regions on behavior classification using SHapley Additive exPlanation (SHAP) value, and find that the somatosensory and premotor regions play a large role in behavioral classification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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