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Enregistrement W4376223988 · doi:10.1111/vox.13440

Proof of concept for detection of staphylococcal enterotoxins in platelet concentrates as a novel safety mitigation strategy

2023· article· en· W4376223988 sur OpenAlexafffund
Sylvia Ighem, Basit Yousuf, Carina Paredes, Jennifer Bearne, Carl McDonald, Sandra Ramírez‐Arcos

Notice bibliographique

RevueVox Sanguinis · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePlatelet Disorders and Treatments
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesHealth CanadaCanadian Blood Services
Mots-clésStaphylococcus aureusMicrobiologyEnterotoxinExotoxinBlotBiologyTryptic soy brothToxinMolecular biologyGeneBacteriaEscherichia coliGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVES: Staphylococcus aureus is a predominant contaminant of platelet concentrates (PCs) that can evade detection during screening with culture methods. Importantly, S. aureus produces staphylococcal enterotoxins (SEs) during PC storage, which are linked to slow growth and enhanced biofilm formation. This study investigated timing of SE production during PC storage and feasibility of SE detection as a PC safety strategy. MATERIALS AND METHODS: Genomic and transcriptomic data of transfusion-relevant S. aureus PS/BAC/169/17/W, PS/BAC/317/16/W, CI/BAC/25/13/W and CBS2016-05 were used to determine the presence and differential expression of exotoxin genes in PCs. Trypticase soy broth (TSB) and PCs were inoculated with 1.0E+06 cfu/mL of S. aureus PS/BAC/169/17/W and CBS2016-05. Expression of SEs at different growth phases was confirmed with Western blotting. PCs were inoculated with 30 cfu/unit of the same strains, and SE detection during PC storage was optimized with a sandwich dot-ELISA assay. RESULTS: S. aureus genomes contain multiple exotoxin genes including those encoding for SEs. Transcriptome data revealed significant upregulation (0.5-6.7-fold, p < 0.05) of SE genes in PCs versus TSB. Western blots demonstrated SE production at all growth phases. Notably, dot-ELISA detected clinically relevant concentrations of SEs (~0.2 μg/mL) at 32 h of PC storage when S. aureus PS/BAC/169/17/W and CBS2016-05 counts were 1.8E+04 and 1.4E+04 cfu/mL, respectively. CONCLUSION: Genomic analyses revealed that staphylococcal exotoxins are widely distributed and highly conserved among transfusion-relevant S. aureus isolates. Furthermore, SEs are significantly upregulated in PCs and detected at 30 h of PC storage. Therefore, bacterial toxin detection could supplement mitigation strategies to enhance PC safety.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,437

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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