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Enregistrement W4376605354 · doi:10.1089/vim.2023.0059.editorial

How Can We Predict Disease Severity in Viral Infections?

2023· editorial· en· W4376605354 sur OpenAlexaff
Rodney S. Russell

Notice bibliographique

RevueViral Immunology · 2023
Typeeditorial
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDownloadViral infectionDiseaseCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Library scienceInfectious disease (medical specialty)ImmunologyVirologyMedicineBiologyGerontologyVirusInternal medicineWorld Wide WebComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

W hen individuals become infected with any virus, the first question often is, how sick will they get?The coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic highlighted this notion for all of us.The greatest risk factor for hospitalization and death was quickly realized to be age, but as always, there were exceptions.There were cases of young vaccinated individuals getting very sick with COVID-19, and at the same time, most of us know of an elderly individual who experienced only mild symptoms, even before vaccines were available.Now that the urgency of the pandemic seems to have subsided, we finally have time to truly understand this virus and the disease it causes.One main focus going forward will be to figure out what else predicts disease severity, who is most at risk for severe disease, as well as which factors contribute to the development of long COVID-19.Many virus infections present with similar inflammatory profiles, and for many of these infections, we do not yet know what predicts disease severity.In this issue, Jose et al. have investigated the expression of indoleamine 2,3dioxygenase (IDO) 1 pathway genes in severe dengue patients.Using a principal component analysis, the authors examined the relationships between gene expression profiles and disease severity, as well as laboratory markers of clinical severity.Based on their findings, they concluded that profiling the baseline expression patterns of IDO pathway genes can aid in the identification of dengue patients most at risk for severe disease.Also on the topic of innate immunity, Zhang et al. examined Toll-like receptor 3 (TLR3) gene single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 370 Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV; HHV8)-infected patients to look for effects on interferon (IFN)-c levels.The authors identified two TLR3 SNPs that showed protective effects against KSHV infection, and from this they concluded that genetic variants in TLR3 reduce the risk of KSHV infection and affect KSHV reactivation among HIV-infected individuals, especially in the Uyghur population.As already mentioned, the ability to predict disease severity in COVID-19 would be extremely valuable.In an article by Gabr et al., T lymphocyte subsets and NK cells

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,031
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,086
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,164

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0310,086
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,004
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0030,005
Communication savante0,0090,008
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0230,042
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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