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Enregistrement W4376608905 · doi:10.1016/j.toxrep.2023.05.005

Investigation of the relationship between ergocristinine and vascular receptors

2023· article· en· W4376608905 sur OpenAlexafffund
Jensen E. Cherewyk, Barry Blakley, Ahmad Al‐Dissi

Notice bibliographique

RevueToxicology Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueChemical synthesis and alkaloids
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Diabetes FoundationMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésReceptorChemistryComputational biologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ergot alkaloids are secondary metabolites that exist in two configurations, the C-8-R-isomer (R-epimer), and the C-8-S-isomer (S-epimer). Toxic effects of ergot, such as vasoconstriction, have been primarily attributed to the R-epimer bioactivity, as compared to the S-epimer. Recent studies demonstrated potential bioactivity of S-epimers. Therefore, further cost-effective investigations of the S-epimers are needed. The present study investigated the S-epimer - vascular receptor binding relationship. An in silico molecular docking approach, utilizing AutoDock Vina and DockThor, was used to determine if the S-epimer (ergocristinine) binds to vascular receptors and to compare the binding affinity and interactions to the corresponding R-epimer (ergocristine) and a structural analogue (lysergic acid amide). The binding energy (kcal/mol) of ergocristinine was − 9.7 or − 11.0 to the serotonin (5-HT) 2 A receptor and − 8.7 or − 11.4 to the alpha 2 A adrenergic receptor, depending on the software used. A hydrogen bond was formed between ergocristinine and amino acid residues of the 5-HT 2 A and alpha 2 A adrenergic receptor binding sites, with bond lengths of 3.10 Å and 3.28 Å, respectively. Binding affinities and molecular interactions among the ligands to each receptor differed. Different affinities and interactions may relate to differences in the chemical structures. The binding affinities and strong molecular interactions of the S-epimer to vascular receptors may contribute to the observed physiological manifestations that occur after ergot alkaloid exposure. The results of the present study suggest further investigation on the receptor binding of the S-epimers of ergot alkaloids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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