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Enregistrement W4376612596 · doi:10.1101/2023.05.12.540561

Functional Characterization of Calmodulin-like Proteins, CML13 and CML14, as Novel Light Chains of Arabidopsis Class VIII Myosins

2023· preprint· en· W4376612596 sur OpenAlexafffund
Kyle Symonds, Howard J. Teresinski, Bryan Hau, Einat Sadot, Vikas Dwivedi, Eduard Belausov, Sefi Bar-Sinai, M. Tominaga, Takeshi Haraguchi, Kohji Ito, Wayne A. Snedden

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesQueen's University
Mots-clésMyosinCalmodulinMyosin light-chain kinaseArabidopsisBiochemistryBiologyMotor proteinGene isoformActinFusion proteinCell biologyEF handRecombinant DNAEnzymeGeneMicrotubule

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Myosins are important motor proteins that associate with the actin cytoskeleton. Structurally, myosins function as heteromeric complexes where smaller light chains, such as calmodulin (CaM), bind to isoleucine-glutamine (IQ) domains in the neck regions to facilitate mechano-enzymatic activity. We recently identified Arabidopsis CaM-like (CML) proteins, CML13 and CML14 as interactors of proteins containing multiple IQ domains, including a member of the myosin VIII class. Here, using in vivo and in vitro assays we demonstrate that CaM, CML13, and CML14 bind the neck region of all four Arabidopsis myosin VIII isoforms. Among ten CML isoforms tested for in planta binding to myosins VIIIs, CaM, CML13, and CML14 gave the strongest signals using in planta split-luciferase protein-interaction assays. In vitro, recombinant CaM, CML13, and CML14 showed specific, high-affinity, calcium-independent binding to the IQ domains of myosin VIIIs. Subcellular localization analysis indicated that CaM, CML13, and CML14 co-localized to plasma membrane-bound puncta when co-expressed with RFP-myosin fusion proteins containing IQ- and tail-domains of myosin VIIIs. In addition, in vitro actin-motility assays using recombinant myosin holoenzymes demonstrated that CaM, CML13, and CML14 function as light chains for myosin VIIIs. Collectively, our data indicate that Arabidopsis CML13 and CML14 are novel myosin VIII light chains. Highlight Myosins are key proteins in the plant cytoskeleton, but the identity of their light chain components is unknown. Here, we show that calmodulin-like proteins function as novel myosin light chains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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