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Enregistrement W4376613717 · doi:10.1016/j.esmoop.2023.101290

66P Digital profiling of immune biomarkers: Relation to anthracycline benefit

2023· article· en· W4376613717 sur OpenAlexaffabout
Elahe Shenasa, Yujun He, Zhonghua Wang, Dongsheng Tu, Dongxia Gao, Zuzana Kos, S. Thornton, Torsten O. Nielsen

Notice bibliographique

RevueESMO Open · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensVancouver General HospitalQueen's UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCyclophosphamideBreast cancerOncologyImmune systemAnthracyclineMedicineEpirubicinInternal medicineChemotherapyImmunologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent studies have shown that the tumor microenvironment can shape the response to immune-modulating therapies. Anthracyclines are a major chemotherapy regimen for breast cancer that induce immunogenic cell death. We hypothesized that patients with “immune hot” tumors may benefit from anthracyclines more than patients with “immune cold” tumors. As one of the largest breast cancer studies using the GeoMx digital spatial profiling, we tested this hypothesis by profiling 35 biomarkers on 536 cases obtained from the Canadian Cancer Trials Group MA.5 phase III clinical trial. In this trial, node-positive breast cancer patients were randomized to receive either a cyclophosphamide-based (cyclophosphamide-methotrexate-fluorouracil (CMF)) or anthracycline-containing adjuvant chemotherapy (cyclophosphamide-epirubicin-fluorouracil (CEF)). Tissue microarray sections were stained with barcoded antibodies to obtain digitally quantified biomarker counts. Unsupervised hierarchical clustering revealed two patient clusters: immune infiltrated and ignored. Following a pre-specified statistical plan crafted to meet ReMARK (REporting recommendations for tumor MARKer prognostic studies) guidelines, we did not observe significant results for the primary hypotheses: Immune cluster assignment did not predict an improved 10-year relapse-free survival or overall survival for patients receiving CEF compared to CMF in the full cohort. However, some of our secondary hypotheses revealed a significant predictive value for immune cluster assignment and stromal tumor infiltrating lymphocytes assessed on hematoxylin and eosin (H&E)-stained sides for CEF benefit over CMF in the human epidermal growth factor receptor 2 (HER2)-enriched subset. As an exploratory analysis, supervised clustering of immune biomarkers suggested that low levels of TIM-3 and high levels of HLA-DR and PD-L1 were associated with an extra benefit from CEF compared with CMF. While novel multiplexing techniques provide a detailed insight into the tumor microenvironment, conventional H&E staining acts as a powerful tool to assess the value of immune microenvironment in predicting benefits from immunogenic chemotherapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,722
Score d'incertitude au seuil0,358

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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