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Enregistrement W4376618224 · doi:10.1089/apb.2022.0044

The Biosafety Research Road Map: The Search for Evidence to Support Practices in the Laboratory—Crimean Congo Haemorrhagic Fever Virus and Lassa Virus

2023· review· en· W4376618224 sur OpenAlexfundno aff
Stuart D. Blacksell, Sandhya Dhawan, Marina Kusumoto, Kim Khanh Le, Kathrin Summermatter, Joseph O’Keefe, Joseph P. Kozlovac, Salama Suhail Almuhairi, Indrawati Sendow, Christina M. Scheel, Anthony Ahumibe, Zibusiso M. Masuku, Allan Bennett, Kazunobu Kojima, David R. Harper, Keith Hamilton

Notice bibliographique

RevueApplied Biosafety · 2023
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDefence Science and Technology GroupDefence Science and Technology LaboratoryGlobal Affairs CanadaWellcome TrustWorld Health Organization
Mots-clésLassa virusLassa feverBiosafetyEbola virusVirologyInfectious disease (medical specialty)VirusMedicineCase fatality rateEnvironmental healthBiologyVeterinary medicineDiseaseBiotechnologyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Crimean Congo Hemorrhagic Fever (CCHF) virus and Lassa virus (LASV) are zoonotic agents regarded as high-consequence pathogens due to their high case fatality rates. CCHF virus is a vector-borne disease and is transmitted by tick bites. Lassa virus is spread via aerosolization of dried rat urine, ingesting infected rats, and direct contact with or consuming food and water contaminated with rat excreta. Methods: The scientific literature for biosafety practices has been reviewed for both these two agents to assess the evidence base and biosafety-related knowledge gaps. The review focused on five main areas, including the route of inoculation/modes of transmission, infectious dose, laboratory-acquired infections, containment releases, and disinfection and decontamination strategies. Results: There is a lack of data on the safe collection and handling procedures for tick specimens and the infectious dose from an infective tick bite for CCHF investigations. In addition, there are gaps in knowledge about gastrointestinal and contact infectious doses for Lassa virus, sample handling and transport procedures outside of infectious disease areas, and the contribution of asymptomatic carriers in viral circulation. Conclusion: Due to the additional laboratory hazards posed by these two agents, the authors recommend developing protocols that work effectively and safely in highly specialized laboratories in non-endemic regions and a laboratory with limited resources in endemic areas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,031
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,088
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,163

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0310,088
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,005
Bibliométrie0,0180,011
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0070,007
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,399
Tête enseignante GPT0,530
Écart entre enseignants0,130 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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