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Enregistrement W4376867172 · doi:10.1101/2023.05.16.23290051

Clonal Hematopoiesis of Indeterminate Potential is Associated with Acute Kidney Injury

2023· preprint· en· W4376867172 sur OpenAlexaff
Caitlyn Vlasschaert, Cassianne Robinson‐Cohen, Bryan Kestenbaum, Samuel A. Silver, Jianchun Chen, Elvis A. Akwo, Pavan K. Bhatraju, Ming‐Zhi Zhang, Shirong Cao, Ming Jiang, Yinqiu Wang, Aolei Niu, Edward D. Siew, Holly Kramer, Anna Köttgen, Nora Franceschini, Bruce M. Psaty, Russell P. Tracy, Álvaro Alonso, Dan E. Arking, Josef Coresh, Christie M. Ballantyne, Eric Boerwinkle, Morgan E. Grams, Matthew B. Lanktree, Michael J. Rauh, Raymond C. Harris, Alexander G. Bick

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonMcMaster UniversityPopulation Health Research InstituteImpactQueen's University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésAcute kidney injuryMedicineInternal medicineKidney diseaseDialysisDiseaseCohortOncologyMyeloid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Age is a predominant risk factor for acute kidney injury (AKI), yet the biological mechanisms underlying this risk are largely unknown and to date no genetic mechanisms for AKI have been established. Clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP) is a recently recognized biological mechanism conferring risk of several chronic aging diseases including cardiovascular disease, pulmonary disease and liver disease. In CHIP, blood stem cells acquire mutations in myeloid cancer driver genes such as DNMT3A, TET2, ASXL1 and JAK2 and the myeloid progeny of these mutated cells contribute to end-organ damage through inflammatory dysregulation. We sought to establish whether CHIP causes acute kidney injury (AKI). To address this question, we first evaluated associations with incident AKI events in three population-based epidemiology cohorts (N = 442,153). We found that CHIP was associated with a greater risk of AKI (adjusted HR 1.26, 95% CI: 1.19–1.34, p<0.0001), which was more pronounced in patients with AKI requiring dialysis (adjusted HR 1.65, 95% CI: 1.24–2.20, p=0.001). The risk was particularly high in the subset of individuals where CHIP was driven by mutations in genes other than DNMT3A (HR: 1.49, 95% CI: 1.37–1.61, p<0.0001). We then examined the association between CHIP and recovery from AKI in the ASSESS-AKI cohort and identified that non- DNMT3A CHIP was more common among those with a non-resolving pattern of injury (HR 2.3, 95% CI: 1.14–4.64, p = 0.03). To gain mechanistic insight, we evaluated the role of Tet2 -CHIP to AKI in ischemia-reperfusion injury (IRI) and unilateral ureteral obstruction (UUO) mouse models. In both models, we observed more severe AKI and greater post-AKI kidney fibrosis in Tet2 -CHIP mice. Kidney macrophage infiltration was markedly increased in Tet2 -CHIP mice and Tet2 -CHIP mutant renal macrophages displayed greater pro-inflammatory responses. In summary, this work establishes CHIP as a genetic mechanism conferring risk of AKI and impaired kidney function recovery following AKI via an aberrant inflammatory response in CHIP derived renal macrophages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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