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Enregistrement W4376872254 · doi:10.1093/plphys/kiad286

Transcriptionally linked simultaneous overexpression of P450 genes for broad-spectrum herbicide resistance

2023· article· en· W4376872254 sur OpenAlexfundno aff
Hiroe Suda, T. Kubo, Yusuke Yoshimoto, Keisuke Tanaka, Satoru Tanaka, Akira Uchino, Satoshi Azuma, Makoto Hattori, Takuya Yamaguchi, Masahiro Miyashita, Tohru Tominaga, Satoshi Iwakami

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWeed Control and Herbicide Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyJapan Society for the Promotion of ScienceTokyo University of AgricultureNODAI Genome Research Center, Tokyo University of AgricultureYoshida Scholarship Foundation
Mots-clésBiologyGeneCytochrome P450GeneticsMonooxygenaseGene expressionFunction (biology)Transcription (linguistics)SyntenyBiochemistryEnzymeGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Broad-spectrum herbicide resistance (BSHR), often linked to weeds with metabolism-based herbicide resistance, poses a threat to food production. Past studies have revealed that overexpression of catalytically promiscuous enzymes explains BSHR in some weeds; however, the mechanism of BSHR expression remains poorly understood. Here, we investigated the molecular basis of high-level resistance to diclofop-methyl in BSHR late watergrass (Echinochloa phyllopogon) found in the United States, which cannot be solely explained by the overexpression of promiscuous cytochrome P450 monooxygenases CYP81A12/21. The BSHR late watergrass line rapidly produced 2 distinct hydroxylated diclofop acids, only 1 of which was the major metabolite produced by CYP81A12/21. RNA-seq and subsequent reverse transcription quantitative PCR (RT-qPCR)-based segregation screening identified the transcriptionally linked overexpression of a gene, CYP709C69, with CYP81A12/21 in the BSHR line. The gene conferred diclofop-methyl resistance in plants and produced another hydroxylated diclofop acid in yeast (Saccharomyces cerevisiae). Unlike CYP81A12/21, CYP709C69 showed no other herbicide-metabolizing function except for a presumed clomazone-activating function. The overexpression of the 3 herbicide-metabolizing genes was also identified in another BSHR late watergrass in Japan, suggesting a convergence of BSHR evolution at the molecular level. Synteny analysis of the P450 genes implied that they are located at mutually independent loci, which supports the idea that a single trans-element regulates the 3 genes. We propose that transcriptionally linked simultaneous overexpression of herbicide-metabolizing genes enhances and broadens the metabolic resistance in weeds. The convergence of the complex mechanism in BSHR late watergrass from 2 countries suggests that BSHR evolved through co-opting a conserved gene regulatory system in late watergrass.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,910
Score d'incertitude au seuil0,191

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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