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Enregistrement W4376959451 · doi:10.1093/braincomms/fcad156

Cation leak: a common functional defect causing <i>HCN1</i> developmental and epileptic encephalopathy

2023· article· en· W4376959451 sur OpenAlexaff
Chaseley E. McKenzie, Ian C. Forster, Ming S. Soh, A. Marie Phillips, Lauren E. Bleakley, Sophie Russ-Hall, Kenneth A. Myers, Ingrid E. Scheffer, Christopher A. Reid

Notice bibliographique

RevueBrain Communications · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilAustralian Government
Mots-clésXenopusEpilepsySodium channelEncephalopathyChannelopathyLeakMedicineGatingInternal medicineBiologyChemistryNeuroscienceSodiumGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pathogenic variants in HCN1 are an established cause of developmental and epileptic encephalopathy (DEE). To date, the stratification of patients with HCN1-DEE based on the biophysical consequence on channel function of a given variant has not been possible. Here, we analysed data from eleven patients carrying seven different de novo HCN1 pathogenic variants located in the transmembrane domains of the protein. All patients were diagnosed with severe disease including epilepsy and intellectual disability. The functional properties of the seven HCN1 pathogenic variants were assessed using two-electrode voltage-clamp recordings in Xenopus oocytes. All seven variants showed a significantly larger instantaneous current consistent with cation leak. The impact of each variant on other biophysical properties was variable, including changes in the half activation voltage and activation and deactivation kinetics. These data suggest that cation leak is an important pathogenic mechanism in HCN1-DEE. Furthermore, published mouse model and clinical case reports suggest that seizures are exacerbated by sodium channel blockers in patients with HCN1 variants that cause cation leak. Stratification of patients based on their ‘cation leak’ biophysical phenotype may therefore provide key information to guide clinical management of individuals with HCN1-DEE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,927
Score d'incertitude au seuil0,535

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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