MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4377004358 · doi:10.59275/j.melba.2022-a1cc

Image quality assessment by overlapping task-specific and task-agnostic measures: application to prostate multiparametric MR images for cancer segmentation

2022· article· en· W4377004358 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Machine Learning for Biomedical Imaging · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCRIS Cancer FoundationUniversity of ManchesterNational Cancer InstituteUniversity College LondonNational Institutes of HealthWellcome / EPSRC Centre for Interventional and Surgical SciencesEngineering and Physical Sciences Research CouncilProstate Cancer FoundationUniversity of CambridgeCancer Research UKKnight Cancer Institute, Oregon Health and Science UniversityOregon Health and Science University
Mots-clésTask (project management)Computer scienceImage qualityQuality (philosophy)Artificial intelligenceSegmentationImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Image quality assessment (IQA) in medical imaging can be used to ensure that downstream clinical tasks can be reliably performed. Quantifying the impact of an image on the specific target tasks, also named as task amenability, is needed. A <em>task-specific</em> IQA has recently been proposed to learn an image-amenability-predicting controller simultaneously with a target task predictor. This allows for the trained IQA controller to measure the impact an image has on the target task performance, when this task is performed using the predictor, e.g. segmentation and classification neural networks in modern clinical applications. In this work, we propose an extension to this task-specific IQA approach, by adding a <em>task-agnostic</em> IQA based on auto-encoding as the target task. Analysing the intersection between low-quality images, deemed by both the task-specific and task-agnostic IQA, may help to differentiate the underpinning factors that caused the poor target task performance. For example, common imaging artefacts may not adversely affect the target task, which would lead to a low task-agnostic quality and a high task-specific quality, whilst individual cases considered clinically challenging, which can not be improved by better imaging equipment or protocols, is likely to result in a high task-agnostic quality but a low task-specific quality. We first describe a flexible reward shaping strategy which allows for the adjustment of weighting between task-agnostic and task-specific quality scoring. Furthermore, we evaluate the proposed reinforcement learning algorithm, using a clinically challenging target task of prostate tumour segmentation on multiparametric magnetic resonance (mpMR) images. Based on experimental results using mpMR images from 850 patients, it was found that <em>a</em>) The task-agnostic IQA may identify artefacts, but with limited impact on the accuracy of cancer segmentation networks. A Dice score of 0.367±0.017 was obtained after rejecting 10% of low quality images, compared to 0.354±0.016 from a non-selective baseline; <em>b</em>} The task-specific IQA alone improved the performance to 0.415±0.020, at the same rejection ratio. However, this system indeed rejected both images that impact task performance due to imaging defects and due to being clinically challenging; and <em>c</em>) The proposed reward shaping strategy, when the task-agnostic and task-specific IQA are weighted appropriately, successfully identified samples that need re-acquisition due to defected imaging process, as opposed to clinically challenging cases due to low contrast in pathological tissues or other equivocacy in radiological presentation.<br>Our code is available at https://github.com/s-sd/task-amenability/tree/v1

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,839
Score d'incertitude au seuil0,763

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle