Changes in the Incidence of Invasive Pneumococcal Disease in Calgary, Canada, during the SARS-CoV-2 Pandemic 2020–2022
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
We describe the impact of non-pharmaceutical interventions (NPIs) during the COVID-19 pandemic on invasive pneumococcal disease (IPD) in Calgary. IPD declined significantly worldwide during 2020 and 2021. This may be due to the reduced transmission of and decrease in circulating viruses that often co-infect with the opportunistic pneumococcus. Pneumococcus has not been shown to frequently co-infect or cause secondary infection with SARS-CoV-2. We examined and compared incidence rates in Calgary per quarter in the pre-vaccine, post-vaccine, 2020 and 2021 (pandemic) and 2022 (late pandemic) eras. We also conducted a time series analysis from 2000-2022 allowing for change in trend at introduction of vaccines and for initiation of NPIs during the COVID-19 pandemic. Incidence declined in 2020/2021 but by the end of 2022 had begun to rapidly recover to near pre-vaccine rates. This recovery may be related to the high rates of viral activity in the winter of 2022 along with childhood vaccines being delayed during the pandemic. However, a large proportion of the IPD caused in the last quarter of 2022 was serotype 4, which has caused outbreaks in the homeless population of Calgary in the past. Further surveillance will be important to understand IPD incidence trends in the post-pandemic landscape.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle