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Enregistrement W4377091777 · doi:10.1101/2023.05.16.540926

Molecular Determinants of Calcitriol Signaling and Sensitivity in Glioma Stem-like Cells

2023· preprint· en· W4377091777 sur OpenAlexaff
Sarah Rehbein, Anna-Lena Possmayer, Süleyman Bozkurt, Catharina Lotsch, Julia Gerstmeier, Michael C. Burger, Stefan Momma, Claudia Maletzki, Carl-Friedrich Classen, Thomas M. Freiman, Daniel Dubinski, Katrin Lamszus, Bryan W. Day, Brett W. Stringer, Christel Herold‐Mende, Christian Münch, Donat Kögel, Benedikt Linder

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVitamin D Research Studies
Établissements canadiensPediatric Oncology Group
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalcitriolStem cellCalcitriol receptorCancer researchCancer stem cellGliomaPhenotypeBiologyVitamin D and neurologyBlockadeInternal medicineCell cultureOncologyReceptorEndocrinologyMedicineCell biologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glioblastoma is the most common primary brain cancer in adults and represents one of the worst cancer diagnosis for the patients. Suffering from a poor prognosis and limited treatment options, tumor recurrences are virtually inevitable. Additionally, treatment resistance is very common for this disease and worsens the prognosis. These and others factors are hypothesized to be largely due to the fact that glioblastoma cells are known to be able to obtain stem-like traits and thereby driving these phenotypes. Recently, we could show that the in vitro and ex vivo treatment of glioblastoma stem-like cells with the hormonally active form of Vitamin D3, Calcitriol (1α,25(OH)2-vitamin D3) can block stemness in a subset of cell lines and reduce tumor growth. Here, we expanded our cell panel to over 40 different cultures and can show that, while half of the tested cell lines are sensitive, a quarter can be classified as high-responders. Using genetic and proteomic analysis, we further determined that treatment success can be partially explained by specific polymorphism of the Vitamin D3 receptor and that high-responders display a proteome suggestive of blockade of stemness, as well as migratory potential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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