MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4377093214 · doi:10.1101/2023.05.16.541050

Insights into adipokinetic hormone/corazonin-related peptide receptor specificity and key residues for its activation in the human disease vector <i>Aedes aegypti</i> mosquito

2023· preprint· en· W4377093214 sur OpenAlexaff
Salwa Afifi, Jean‐Paul Paluzzi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAdipokinetic hormoneBiologyReceptorAedes aegyptiG protein-coupled receptorHomology modelingLigand (biochemistry)Cell biologyBiochemistryNeuropeptideEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Adipokinetic hormone/corazonin-related peptide (ACP) and adipokinetic hormone (AKH) are two neuropeptides that demonstrate homology to the vertebrate gonadotropin-releasing hormone (GnRH). Despite the structural similarity and the close evolutionary relationship between the ACP and the AKH, their signaling systems function independently. To date, the role of ACP and its receptor (ACPR) remains unclear in the Aedes aegypti mosquito. Structure-activity relationships (SARs) are often carried out on peptide ligands to determine critical residues for bioactivity and receptor activation; however, residues and features necessary for ligand binding and specificity in the receptors themselves are less studied. Herein, this study focuses on the ACP and AKH signaling systems and examines structural features of their receptors critical for conferring activation and ligand specificity. Firstly, to determine the specific ACPR regions most critical for ligand fidelity and specificity, ACPR chimeras were created by singly replacing each of the three ACPR extracellular loops (ECLs) in their entirety and incorporating the corresponding ECLs from the AKH receptor (AKHR). Heterologous functional assays determined that the three ACPR ECL chimera receptors with complete replacement of full individual ECLs showed no response to either ACP or AKH. These results suggest that the complete replacement of each individual extracellular loop is detrimental to ligand binding and recognition. Secondly, through a more targeted approach, we aimed to determine specific residues critical for functional ligand-binding by substituting only select highly conserved residues within the three ECLs of the ACPR with those from the AKHR. Modifications of specific and highly conserved residues in these ACPR ECLs chimeras suggest that the third extracellular loop contains the most critical residues necessary for ACP binding and receptor activation. In addition, the combination of two selectively-modified ACPR ECLs demonstrated a significant decrease in response to ACP compared to the native ACPR response. Interestingly, combining all of the ACPR ECLs chimeras together resulted in a significant decrease in response to ACP compared to native ACPR. Relatedly, a significantly increased response to AKH was observed in the receptor chimera combining selected modifications in all three ECLs compared to native ACPR. Hence, the particular residues essential for ACP ligand interaction were identified due to the detrimental effect that occurred in ACPR activation after the selective modification of crucial residues localized within the three extracellular domains of the receptor. These data provide key insight into how these two closely related neuropeptidergic systems maintain functional independence in the mosquito A. aegypti as well as other insects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetNeurobiology and Insect Physiology Research→Travaux en français237 207→