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Enregistrement W4377093414 · doi:10.1177/17407745231174544

Overview of modern approaches for identifying and evaluating heterogeneous treatment effects from clinical data

2023· article· en· W4377093414 sur OpenAlexaff
Ilya Lipkovich, David Svensson, Bohdana Ratitch, Alex Dmitrienko

Notice bibliographique

RevueClinical Trials · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueAdvanced Causal Inference Techniques
Établissements canadiensBayer (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceCausal inferenceMachine learningArtificial intelligenceSet (abstract data type)Identification (biology)UsabilityObservational studyPersonalized medicinePrecision medicineStatistical inferenceInferenceRandomized experimentData scienceHuman–computer interactionBioinformaticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There has been much interest in the evaluation of heterogeneous treatment effects (HTE) and multiple statistical methods have emerged under the heading of personalized/precision medicine combining ideas from hypothesis testing, causal inference, and machine learning over the past 10-15 years. We discuss new ideas and approaches for evaluating HTE in randomized clinical trials and observational studies using the features introduced earlier by Lipkovich, Dmitrienko, and D'Agostino that distinguish principled methods from simplistic approaches to data-driven subgroup identification and estimating individual treatment effects and use a case study to illustrate these approaches. We identified and provided a high-level overview of several classes of modern statistical approaches for personalized/precision medicine, elucidated the underlying principles and challenges, and compared findings for a case study across different methods. Different approaches to evaluating HTEs may produce (and actually produced) highly disparate results when applied to a specific data set. Evaluating HTE with machine learning methods presents special challenges since most of machine learning algorithms are optimized for prediction rather than for estimating causal effects. An additional challenge is in that the output of machine learning methods is typically a "black box" that needs to be transformed into interpretable personalized solutions in order to gain acceptance and usability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,027
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,099
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,929

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0270,099
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,979
Tête enseignante GPT0,732
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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