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Enregistrement W4377098254 · doi:10.1186/s12866-023-02885-y

Vaginal carriage of Haemophilus influenzae in a non-pregnant reproductive-age population

2023· article· en· W4377098254 sur OpenAlexfundno aff
Meghana Limaye, Sara G. Brubaker, Tara M. Randis, Adam J. Ratner

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNYU Grossman School of MedicineYork University
Mots-clésCarriageBacterial vaginosisBiologyHaemophilus influenzaeHaemophilusCohortPopulationObstetricsInternal medicineMedicineMicrobiologyGeneticsBacteriaPathologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Haemophilus influenzae ( Hi ) is an emerging cause of early onset neonatal sepsis, but mechanisms of transmission are not well understood. We aimed to determine the prevalence of vaginal carriage of Hi in reproductive age women and to examine behavioral and demographic characteristics associated with its carriage. Methods We performed a secondary analysis of stored vaginal lavage specimens from a prospective cohort study of nonpregnant reproductive-age women. After extraction of bacterial genomic DNA, samples were tested for the presence of the gene encoding Haemophilus protein d ( hpd ) by quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) using validated primers and probe. PCR for the V3-V4 region of the 16 S rRNA gene (positive control) assessed sample quality. Samples with cycle threshold (C T ) value < 35 were defined as positive. Sanger sequencing confirmed the presence of hpd . Behavioral and demographic characteristics associated with vaginal carriage of Hi were examined. Results 415 samples were available. 315 (75.9%) had sufficient bacterial DNA and were included. 14 (4.4%) were positive for hpd . There were no demographic or behavioral differences between the women with Hi vaginal carriage and those without. There was no difference in history of bacterial vaginosis, vaginal microbiome community state type, or presence of Group B Streptococcus in women with and without vaginal carriage of Hi . Conclusion Hi was present in vaginal lavage specimens of 4.4% of this cohort. Hi presence was unrelated to clinical or demographic characteristics, though the relatively small number of positive samples may have limited power to detect such differences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,764
Score d'incertitude au seuil0,640

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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