Protein-Protein interaction and quantitative phosphoproteomic studies reveal potential mitochondrial substrates of protein phosphatase 2A-B’ζ holoenzyme
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Protein phosphatase 2A (PP2A) is a heterotrimeric conserved serine/threonine phosphatase complex including a catalytic, scaffolding, and regulatory subunit. Three A Subunits, 17 B subunits, and five C subunits are encoded by the Arabidopsis genome, allowing 255 possible PP2A holoenzyme combinations. The regulatory subunits are crucial for substrate specificity and PP2A complex localization and are classified into B, B’, and B’’ non-related families in land plants. In Arabidopsis , the close homologs B’η, B’θ, B’γ, and B’ζ are further classified into a subfamily of B’ called B’η. Previous studies suggest a role of mitochondrial targeted PP2A subunit (B’ζ) in energy metabolism and plant innate immunity. Potentially, the PP2A-B’ζ holoenzyme is involved in the regulation of the mitochondrial succinate/fumarate translocator or affects enzymes involved in energy metabolism. To investigate this hypothesis, the interaction between PP2A-B’ζ and enzymes involved in the mitochondrial energy flow was investigated using bimolecular fluorescence complementation in tobacco and onion cells. Interaction of B’ζ subunit was confirmed with the Krebs cycle proteins Succinate/fumarate translocator (mSFC1), Malate dehydrogenase (mMDH2), and Aconitase (ACO3). Additional putative interacting candidates were deduced from comparing the enriched phosphoproteomes of wild type and B’ζ mutants: the mitochondrial regulator Arabidopsis pentatricopeptide repeat 6 (PPR6) and the two metabolic enzymes Phosphoenolpyruvate carboxylase (PPC3) and Phosphoenolpyruvate carboxykinase (PCK1). Overall, this study identifies potential PP2A substrates and highlights the role of PP2A in regulating energy metabolism in mitochondria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».