Proximal Methionine Amino Acid Residue Affects the Properties of Redox-Active Tryptophan in an Artificial Model Protein
Notice bibliographique
Résumé
High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Redox-active amino acid residues are at the heart of biological electron-transfer reactions. They play important roles in natural protein functions and are implicated in disease states (e.g., oxidative-stress-associated disorders). Tryptophan (Trp) is one such redox-active amino acid residue, and it has long been known to serve a functional role in proteins. Broadly speaking, there is still much to learn about the local features that make some Trp redox active and others inactive. Herein, we describe a new protein model system where we investigate how a methionine (Met) residue proximal to a redox-active Trp affects its reactivity and spectroscopy. We use an artificial variant of azurin from Pseudomonas aeruginosa to produce these models. We employ a series of UV–visible spectroscopy, electrochemistry, electron paramagnetic resonance, and density functional theory experiments to demonstrate the effect that placing Met near Trp radicals has in the context of redox proteins. The introduction of Met proximal to Trp lowers its reduction potential by ca. 30 mV and causes clear shifts in the optical spectra of the corresponding radicals. While the effect may be small, it is significant enough to be a way for natural systems to tune Trp reactivity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».