Porcine Circovirus Modulates Swine Influenza Virus Replication in Pig Tracheal Epithelial Cells and Porcine Alveolar Macrophages
Notice bibliographique
Résumé
The pathogenesis of porcine circovirus type 2b (PCV2b) and swine influenza A virus (SwIV) during co-infection in swine respiratory cells is poorly understood. To elucidate the impact of PCV2b/SwIV co-infection, newborn porcine tracheal epithelial cells (NPTr) and immortalized porcine alveolar macrophages (iPAM 3D4/21) were co-infected with PCV2b and SwIV (H1N1 or H3N2 genotype). Viral replication, cell viability and cytokine mRNA expression were determined and compared between single-infected and co-infected cells. Finally, 3'mRNA sequencing was performed to identify the modulation of gene expression and cellular pathways in co-infected cells. It was found that PCV2b significantly decreased or improved SwIV replication in co-infected NPTr and iPAM 3D4/21 cells, respectively, compared to single-infected cells. Interestingly, PCV2b/SwIV co-infection synergistically up-regulated IFN expression in NPTr cells, whereas in iPAM 3D4/21 cells, PCV2b impaired the SwIV IFN induced response, both correlating with SwIV replication modulation. RNA-sequencing analyses revealed that the modulation of gene expression and enriched cellular pathways during PCV2b/SwIV H1N1 co-infection is regulated in a cell-type-dependent manner. This study revealed different outcomes of PCV2b/SwIV co-infection in porcine epithelial cells and macrophages and provides new insights on porcine viral co-infections pathogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».