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Enregistrement W4377694396 · doi:10.21203/rs.3.rs-2950610/v1

Radiomic tractometry: a rich and tract-specific class of imaging biomarkers for neuroscience and medical applications

2023· preprint· en· W4377694396 sur OpenAlexfundno aff
Peter Neher, Dušan Hirjak, Klaus Maier‐Hein

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchAvid RadiopharmaceuticalsAllerganGenentechNational Institutes of HealthIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNeurocrine BiosciencesNovartis Pharmaceuticals CorporationVoyager TherapeuticsBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheCelgeneMeso Scale DiagnosticsTeva Pharmaceutical IndustriesVerily Life SciencesNorthern California Institute for Research and EducationUniversity of Southern CaliforniaDeutsche ForschungsgemeinschaftGlaxoSmithKlineU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbAlzheimer's AssociationMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchFoundation for the National Institutes of HealthAlzheimer's Disease Neuroimaging Initiative
Mots-clésPython (programming language)Computer scienceDiffusion MRINeuroimagingData scienceNeuroscienceArtificial intelligencePsychologyMedicineMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tract-specific microstructural analysis of the brain white matter using diffusion MRI is a driver for neuroscientific discovery with a wide range of applications. Current analysis pipelines have conceptual limitations that narrow their applicability and hamper subject-level analysis and predictions. Radiomic tractometry (RadTract) improves upon that, enabling the extraction and analysis of comprehensive and highly informative microstructural feature sets where previous approaches were restricted to bare summary statistics. We demonstrate the added value in a series of neuroscientific applications, including diagnostic tasks as well as the prediction of demographic and clinical measures across various datasets. Being published as an open and easy-to-use Python package, RadTract could spark the establishment of a new generation of tract-specific imaging biomarkers, with direct benefits for a range of applications from basic neuroscience to medical research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,211
Tête enseignante GPT0,496
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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