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Enregistrement W4377981126 · doi:10.1016/j.ebiom.2023.104623

Evaluation of pre-diagnostic blood protein measurements for predicting survival after lung cancer diagnosis

2023· article· en· W4377981126 sur OpenAlexfundno aff
Xiaoshuang Feng, David C. Muller, Hana Zahed, Karine Alcala, Florence Guida, Karl Smith-Byrne, Jian‐Min Yuan, Woon‐Puay Koh, Renwei Wang, Roger L. Milne, Julie K. Bassett, Arnulf Langhammer, Kristian Hveem, Victoria L. Stevens, Ying Wang, Mikael Johansson, Anne Tjønneland, ­Rosario ­Tumino, Mahdi Sheikh, Mattias Johansson, Hilary A. Robbins

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteFaculty of Medicine and Health, University of SydneySchool of Public Health, Imperial College LondonRijksinstituut voor Volksgezondheid en MilieuMedical Research CouncilNorwegian Institute of Public HealthCenters for Disease Control and PreventionNational Institutes of HealthConsejería de Salud y Familias, Junta de AndalucíaMutuelle Générale de l'Education NationaleInstitut Gustave-RoussyNational Health and Medical Research CouncilInstitut National Du CancerCancer Council VictoriaDeutsche KrebshilfeAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroLigue Contre le CancerDeutsches KrebsforschungszentrumCancer Research Foundation in Northern SwedenInstituto de Salud Carlos IIIHelse Midt-NorgeHealth Research FoundationVetenskapsrådetInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleVicHealthImperial College LondonMinistère des Affaires Sociales et de la SantéFaculté de médecine et des sciences de la santé, Université de SherbrookeWorld Health OrganizationCancer Research UKCancerfondenSchool of Public Health, Portland State UniversityNorges Teknisk-Naturvitenskapelige UniversitetDepartment of Epidemiology and Biostatistics, University of California, San FranciscoKræftens BekæmpelseEuropean CommissionCompagnia di San PaoloUmeå UniversitetBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchWorld Cancer Research FundNational Research CouncilMinisterie van Volksgezondheid, Welzijn en SportNIHR Imperial Biomedical Research CentreCentre International de Recherche sur le Cancer
Mots-clésLung cancerMedicineCancerLungOncologyPathologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: To evaluate whether circulating proteins are associated with survival after lung cancer diagnosis, and whether they can improve prediction of prognosis. METHODS: We measured up to 1159 proteins in blood samples from 708 participants in 6 cohorts. Samples were collected within 3 years prior to lung cancer diagnosis. We used Cox proportional hazards models to identify proteins associated with overall mortality after lung cancer diagnosis. To evaluate model performance, we used a round-robin approach in which models were fit in 5 cohorts and evaluated in the 6th cohort. Specifically, we fit a model including 5 proteins and clinical parameters and compared its performance with clinical parameters only. FINDINGS: There were 86 proteins nominally associated with mortality (p < 0.05), but only CDCP1 remained statistically significant after accounting for multiple testing (hazard ratio per standard deviation: 1.19, 95% CI: 1.10-1.30, unadjusted p = 0.00004). The external C-index for the protein-based model was 0.63 (95% CI: 0.61-0.66), compared with 0.62 (95% CI: 0.59-0.64) for the model with clinical parameters only. Inclusion of proteins did not provide a statistically significant improvement in discrimination (C-index difference: 0.015, 95% CI: -0.003 to 0.035). INTERPRETATION: Blood proteins measured within 3 years prior to lung cancer diagnosis were not strongly associated with lung cancer survival, nor did they importantly improve prediction of prognosis beyond clinical information. FUNDING: No explicit funding for this study. Authors and data collection supported by the US National Cancer Institute (U19CA203654), INCA (France, 2019-1-TABAC-01), Cancer Research Foundation of Northern Sweden (AMP19-962), and Swedish Department of Health Ministry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,728

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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