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Enregistrement W4378195120 · doi:10.1101/2023.05.24.23289628

Genome-wide association study of REM sleep behavior disorder in Parkinson’s disease

2023· preprint· en· W4378195120 sur OpenAlexaff
Yuri L. Sosero, Karl Heilbron, Pierre Fontanillas, Lucy Norcliffe‐Kaufmann, Eric Yu, Uladzislau Rudakou, Jennifer A. Ruskey, Kathryn Freeman, Farnaz Asayesh, Kajsa Brolin, Maria Swanberg, Huw R. Morris, Lesley Wu, Raquel Real, Lasse Pihlstrøm, Manuela Tan, Thomas Gasser, Kathrin Brockmann, Hui Liu, Donald G. Grosset, Simon J.G. Lewis, John B. Kwok, Pau Pástor, Ignacio Álvarez, Matěj Škorvánek, Alexandra Lacková, Miriam Ostrožovičová, Mie Rizig, Lynne Krohn, Ziv Gan‐Or

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMendelian randomizationGenome-wide association studyParkinson's diseaseREM sleep behavior disorderLocus (genetics)Linkage disequilibriumGenetic associationLRRK2DiseaseMedicineInternal medicineAlleleGeneticsSingle-nucleotide polymorphismBiologyGenotypeHaplotypeGenetic variantsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective REM sleep behavior disorder (RBD) is a prodromal synucleinopathy, reported in a subset of Parkinson’s disease (PD) patients, and associated with neuropsychiatric symptoms in PD. We aimed to compare the genetic background of PD patients with probable RBD (PD+RBD) and PD patients without probable RBD (PD-RBD). Furthermore, we examined genetic correlations and potential causal associations between multiple neuropsychiatric traits and PD+RBD. Methods We performed a genome-wide association study (GWAS) including 5,403 PD+RBD and 13,020 PD-RBD. To test for genetic correlations and potential causal associations between neuropsychiatric traits and PD+RBD, we used linkage disequilibrium score regression and Mendelian randomization. Results The SNCA locus was associated with PD+RBD compared to PD-RBD (rs10005233, OR=1.21, 95% CI=1.16-1.27, p =1.81e-15). Further examination of known genetic loci associated with PD from the most recent PD GWAS in Europeans and Asians identified additional variants associated with reduced risk for PD+RBD: two in the SNCA locus (rs5019538-G, OR=0.85, 95% CI=0.81-0.89, p =2.46E-10; rs356182-G, OR=0.89, 95% CI=0.84-0.95, p =0.0001), and one in the LRRK2 locus (rs34637584, p.G2019S, OR=0.41, 95% CI=0.28-0.61, p =1.04E-5). We found a potential genetic correlation between attention deficit hyperactivity disorder (ADHD) and PD+RBD, which was not statistically significant after correction for multiple comparisons. No causative association emerged between PD and neuropsychiatric traits. Interpretation Genetic variants contribute to the occurrence of RBD in PD, further distinguishing between the PD+RBD and PD-RBD subtypes. Understanding the mechanisms underlying these genetic associations could contribute to the development of subtype-specific treatments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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