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Enregistrement W4378220639 · doi:10.1038/s41598-023-35270-w

Automated screening of potential organ donors using a temporal machine learning model

2023· article· en· W4378220639 sur OpenAlexafffund
Nicolas Sauthier, Rima Bouchakri, François Martin Carrier, Michaël Sauthier, Louis Mullie, Héloïse Cardinal, Marie‐Chantal Fortin, Nadia Lahrichi, Michaël Chassé

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOrgan Donation and Transplantation
Établissements canadiensPolytechnique MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - Santé
Mots-clésLogistic regressionMachine learningArtificial intelligenceOrgan donationArtificial neural networkComputer scienceAutoencoderProspective cohort studyMedicineTransplantationInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Organ donation is not meeting demand, and yet 30–60% of potential donors are potentially not identified. Current systems rely on manual identification and referral to an Organ Donation Organization (ODO). We hypothesized that developing an automated screening system based on machine learning could reduce the proportion of missed potentially eligible organ donors. Using routine clinical data and laboratory time-series, we retrospectively developed and tested a neural network model to automatically identify potential organ donors. We first trained a convolutive autoencoder that learned from the longitudinal changes of over 100 types of laboratory results. We then added a deep neural network classifier. This model was compared to a simpler logistic regression model. We observed an AUROC of 0.966 (CI 0.949–0.981) for the neural network and 0.940 (0.908–0.969) for the logistic regression model. At a prespecified cutoff, sensitivity and specificity were similar between both models at 84% and 93%. Accuracy of the neural network model was robust across donor subgroups and remained stable in a prospective simulation, while the logistic regression model performance declined when applied to rarer subgroups and in the prospective simulation. Our findings support using machine learning models to help with the identification of potential organ donors using routinely collected clinical and laboratory data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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