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Enregistrement W4378348012 · doi:10.3389/fvets.2023.1178522

Assessment of accredited veterinary diagnostic laboratory use of breakpoints for canine and feline Escherichia coli infections in the United States and Canada

2023· article· en· W4378348012 sur OpenAlexaboutno aff
Brandon J. Durr, Larry D. Ballard, Angela D. Knight, Keun Seok Seo, Vernon C. Langston, Alexis C. Thompson, Jacob M. Shivley, W. Cooper Brookshire

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Veterinary Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineAntibioticsVeterinary medicineAntibiotic StewardshipCompanion animalDiagnostic testBreakpointFamily medicineAntibiotic resistanceMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to assess the use of breakpoints in antibiotic susceptibility testing among veterinary diagnostic laboratories in the United States and Canada. An eight-question survey was conducted via phone and email to determine how often laboratories use breakpoints consistent with published guidelines in wounds, lower urinary tract infections and upper urinary tract infections (pyelonephritis) involving Escherichia coli , both in dogs and cats, for a total of 6 different hypothetical clinical scenarios. Nineteen veterinary diagnostic laboratories that perform antibiotic susceptibility testing on samples from dogs and cats in the United States or Canada and were accredited by the American Association of Veterinary Laboratory Diagnosticians (AAVLD) responded to the survey between January 15th and September 15th, 2022. The overall response rate of laboratories that were not excluded for known lack of dog and cat antibiotic susceptibility testing was 19 of 44 laboratories. Of the 17 respondent laboratories that reported using minimal inhibitory concentration breakpoints, only four laboratories used breakpoints consistent with published guidelines in all six clinical scenarios included in the survey. Our results suggest that there is clinically important variation in what breakpoints laboratories use to determine antibiotic susceptibility, which is of antibiotic stewardship and clinical relevance. Using breakpoints that are too high, too low, or inappropriately reporting “not interpreted” as the interpretive category may result in inappropriate use of antibiotics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,757
Score d'incertitude au seuil0,971

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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