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Enregistrement W4378363830 · doi:10.1021/acs.jmedchem.3c00398

Investigation into the Mechanism of Action of the Tuberculosis Drug Candidate SQ109 and Its Metabolites and Analogues in Mycobacteria

2023· article· en· W4378363830 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2023
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueBioactive Compounds and Antitumor Agents
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignNational Institutes of HealthScience Foundation Ireland
Mots-clésMycobacterium smegmatisMycobacterium tuberculosisChemistryMechanism of actionGrowth inhibitionMetaboliteBiochemistryPhosphataseMycobacteriumBedaquilineEnzymeCell growthIC50BiosynthesisTuberculosisBacteriaMicrobiologyIn vitroBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We tested a series of SQ109 analogues against Mycobacterium tuberculosis and M. smegmatis, in addition to determining their uncoupling activity. We then investigated potential protein targets, involved in quinone and cell wall biosynthesis, using “rescue” experiments. There was little effect of menaquinone on growth inhibition by SQ109, but there were large increases in the IC 50 of SQ109 and its analogues (up to 20×) on addition of undecaprenyl phosphate (Up), a homologue of the mycobacterial decaprenyl (C 50 ) diphosphate. Inhibition of an undecaprenyl diphosphate phosphatase, an ortholog of the mycobacterial phosphatase, correlated with cell growth inhibition, and we found that M. smegmatis cell growth inhibition could be well predicted by using uncoupler and Up-rescue results. We also investigated whether SQ109 was metabolized inside Mycobacterium tuberculosis, finding only a single metabolite, previously shown to be inactive. The results are of general interest since they help explain the mechanism of SQ109 in mycobacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,190

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle