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Enregistrement W4378470323 · doi:10.1038/s41467-023-38651-x

Synthetic virology approaches to improve the safety and efficacy of oncolytic virus therapies

2023· article· en· W4378470323 sur OpenAlexafffund
Taha Azad, Reza Rezaei, Ragunath Singaravelu, Adrian Pelin, Stephen Boulton, Julia Petryk, Kemal Alper Onsu, Nikolas T. Martin, Victoria Hoskin, Mina Ghahremani, Marie Marotel, Ricardo Marius, Xiaohong He, Mathieu J. F. Crupi, Huy‐Dung Hoang, Abolfazl Nik-Akhtar, Mahsa Ahmadi, Nika Kooshki Zamani, Ashkan Golshani, Tommy Alain, Peter A. Greer, Michele Ardolino, Bryan C. Dickinson, Lee‐Hwa Tai, Carolina S. Ilkow, John C. Bell

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioCarleton UniversityCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeInstitute of Infection and ImmunityUniversity of OttawaOttawa HospitalQueen's UniversityUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCIHR Skin Research Training CentreNational Institute of General Medical SciencesUniversity of OttawaTerry Fox Research InstituteProstate Cancer CanadaCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchMitacsGovernment of Canada
Mots-clésOncolytic virusVirologyVirusMedicineSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)Viral therapyMEDLINEBiologyInfectious disease (medical specialty)Disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The large coding potential of vaccinia virus (VV) vectors is a defining feature. However, limited regulatory switches are available to control viral replication as well as timing and dosing of transgene expression in order to facilitate safe and efficacious payload delivery. Herein, we adapt drug-controlled gene switches to enable control of virally encoded transgene expression, including systems controlled by the FDA-approved rapamycin and doxycycline. Using ribosome profiling to characterize viral promoter strength, we rationally design fusions of the operator element of different drug-inducible systems with VV promoters to produce synthetic promoters yielding robust inducible expression with undetectable baseline levels. We also generate chimeric synthetic promoters facilitating additional regulatory layers for VV-encoded synthetic transgene networks. The switches are applied to enable inducible expression of fusogenic proteins, dose-controlled delivery of toxic cytokines, and chemical regulation of VV replication. This toolbox enables the precise modulation of transgene circuitry in VV-vectored oncolytic virus design.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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