MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4378532875 · doi:10.1186/s13223-023-00796-1

A prognosis prediction chromatin regulator signature for patients with severe asthma

2023· article· en· W4378532875 sur OpenAlexvenueno aff
Yaning Gao, Liang Chen, Jian Li, Zhengjun Wen

Notice bibliographique

RevueAllergy Asthma and Clinical Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquevaccines and immunoinformatics approaches
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNomogramEpigeneticsChromatinAsthmaMedicineImmune systemHistoneBioinformaticsInternal medicineImmunologyBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Severe asthma imposes a physical and economic burden on both patients and society. As chromatin regulators (CRs) influence the progression of multiple diseases through epigenetic mechanisms, we aimed to study the role of CRs in patients with severe asthma. Transcriptome data (GSE143303) from 47 patients with severe asthma and 13 healthy participants was downloaded from the Gene Expression Omnibus database. Enrichment analysis was performed to investigate the functions of differentially expressed CRs between the groups. We identified 80 differentially expressed CRs; they were mainly enriched in histone modification, chromatin organization, and lysine degradation. A protein-protein interaction network was then constructed. The analyzed immune scores were different between sick and healthy individuals. Thus, CRs with a high correlation in the immune analysis, SMARCC1, SETD2, KMT2B, and CHD8, were used to construct a nomogram model. Finally, using online prediction tools, we determined that lanatoside C, cefepime, and methapyrilene may be potentially effective drugs in the treatment of severe asthma. The nomogram constructed using the four CRs, SMARCC1, SETD2, KMT2B, and CHD8, may be a useful tool for predicting the prognosis of patients with severe asthma. This study provided new insights into the role of CRs in severe asthma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,581
Score d'incertitude au seuil0,634

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAllergy Asthma and Clinical ImmunologyMême sujetvaccines and immunoinformatics approachesTravaux en français237 207