Bilayer tension-induced clustering of the UPR sensor IRE1
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The endoplasmic reticulum acts as a protein quality control center where a range of chaperones and foldases facilitates protein folding. IRE1 is a sensory trans-membrane protein that transduces signals of proteotoxic stress by forming clusters and activating a cellular program called the unfolded protein response (UPR). Recently, membrane thickness variation due to membrane compositional changes have been shown to drive IRE1 cluster formation, activating the UPR even in the absence of proteotoxic stress. Here, we demonstrate a direct relationship between bilayer tension and UPR activation based on IRE1 dimer stability. The stability of the IRE1 dimer in a (50%DOPC-50%POPC) membrane at different applied bilayer tensions was analyzed via molecular dynamics simulations. The potential of mean force for IRE1 dimerization predicts a higher concentration of IRE1 dimers for both tensed and compressed ER membranes. This study shows that IRE1 may be a mechanosensitive membrane protein and establishes a direct biophysical relationship between bilayer tension and UPR activation. Highlights Mechanical perturbation of the ER membrane favor oligomerization. Both tension and compression promote IRE1 dimer formation. IRE1 is mechanosensitive, potentially the UPR to changes in ER membrane tension and compression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».