Temperature impacts Atlantic salmon's (Salmo salar) immunological response to infectious salmon anemia virus (ISAv).
Notice bibliographique
Résumé
Ocean temperatures continue to rise annually due to the ever-growing consequences of global climate change. These temperature changes can have an impact on the immunological robustness of cultured fish, especially cold-water species such as Atlantic salmon. The salmon farming industry already loses hundreds of millions of dollars each year to infectious and non-infectious diseases. One particularly important and WOAH reportable disease is infectious salmon anemia caused by the orthomyxovirus ISAv. Considering the changing environment, it is necessary to find ways to mitigate the effect of diseases on the industry. For this study, 20 Atlantic salmon families were housed in each of 38 different tanks at the AVC, with half of the fish being kept at 10 °C and half being kept at 20 °C. Donor Atlantic salmon IP- injected with a highly virulent ISAv isolate (HPR4; TCID50 of 1 × 105/mL) were added to each tank as the source of co-habitation infection. Both temperatures were sampled at onset of mortality in co-habited fish and at resolution of mortality. Family background and temperature significantly impacted ISAv load, as assessed by qPCR, time to mortality and overall mortality. Mortality was more acute at 20 °C, but overall mortality was higher at 10 °C. Based on percent mortality calculated over the course of the study, different families demonstrated different levels of survival. The three families that demonstrated the highest percent mortality, and the three families with the lowest percent mortality were then assessed for their antiviral responses using relative gene expression. Genes significantly upregulated between the unexposed fish and ISAv exposed fish included mx1, il4/13a, il12rb2, and trim25, and these were further impacted by temperature. Understanding how ISAv resistance is impacted by temperature can help identify seasonal risks of ISAv outbreaks as well as ideal responses to be targeted through immunopotentiation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».