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Enregistrement W4378718044 · doi:10.7554/elife.83477

Pharmacological hallmarks of allostery at the M4 muscarinic receptor elucidated through structure and dynamics

2023· article· en· W4378718044 sur OpenAlexaff
Ziva Vuckovic, Jinan Wang, Vi Pham, Jesse I. Mobbs, Matthew J. Belousoff, Apurba Bhattarai, Wessel A. C. Burger, Geoff Thompson, Mahmuda Yeasmin, Vindhya Nawaratne, Katie Leach, Emma T. van der Westhuizen, Elham Khajehali, Yi-Lynn Liang, Alisa Glukhova, Denise Wootten, Craig W. Lindsley, Andrew B. Tobin, Patrick M. Sexton, Radostin Danev, Céline Valant, Yinglong Miao, Arthur Christopoulos, David M. Thal

Notice bibliographique

RevueeLife · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesOffice of Advanced CyberinfrastructureNational Institutes of HealthJapan Science and Technology AgencyNational Health and Medical Research CouncilMonash UniversityPrecursory Research for Embryonic Science and TechnologyNational Energy Research Scientific Computing CenterTakeda Science FoundationAustralian Research CouncilWellcome TrustNational Institute of General Medical SciencesMedical Research CouncilWellcome
Mots-clésAllosteric regulationDrug discoveryAllosteric modulatorG protein-coupled receptorCooperativityAgonistBiophysicsMuscarinic acetylcholine receptorChemistryAllosteric enzymeReceptorNeuroscienceComputational biologyPharmacologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Allosteric modulation of G protein-coupled receptors (GPCRs) is a major paradigm in drug discovery. Despite decades of research, a molecular-level understanding of the general principles that govern the myriad pharmacological effects exerted by GPCR allosteric modulators remains limited. The M 4 muscarinic acetylcholine receptor (M 4 mAChR) is a validated and clinically relevant allosteric drug target for several major psychiatric and cognitive disorders. In this study, we rigorously quantified the affinity, efficacy, and magnitude of modulation of two different positive allosteric modulators, LY2033298 (LY298) and VU0467154 (VU154), combined with the endogenous agonist acetylcholine (ACh) or the high-affinity agonist iperoxo (Ipx), at the human M 4 mAChR. By determining the cryo-electron microscopy structures of the M 4 mAChR, bound to a cognate G i1 protein and in complex with ACh, Ipx, LY298-Ipx, and VU154-Ipx, and applying molecular dynamics simulations, we determine key molecular mechanisms underlying allosteric pharmacology. In addition to delineating the contribution of spatially distinct binding sites on observed pharmacology, our findings also revealed a vital role for orthosteric and allosteric ligand–receptor–transducer complex stability, mediated by conformational dynamics between these sites, in the ultimate determination of affinity, efficacy, cooperativity, probe dependence, and species variability. There results provide a holistic framework for further GPCR mechanistic studies and can aid in the discovery and design of future allosteric drugs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,470

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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