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Enregistrement W4378803075 · doi:10.1139/cjb-2023-0024

Preliminary assessment of the ectomycorrhizal fungi of <i>Quercus garryana</i> on Vancouver Island, British Columbia, Canada

2023· article· en· W4378803075 sur OpenAlexaffvenueabout
Shannon M. Berch, Thomas E. Witte, Joey B. Tanney

Notice bibliographique

RevueBotany · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensNatural Resources CanadaCanadian Forest ServiceUniversity of VictoriaMinistry of Environment
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFagaceaeBiologyRange (aeronautics)EctomycorrhizaEcologyBotanyTemperate rainforestEcosystemMycorrhizaSymbiosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Garry oak ( Quercus garryana Douglas ex Hook.) is the only oak native to British Columbia (BC), where it occupies the northernmost extent of its range. The ecosystem it occupies in BC has been greatly reduced in size and fragmented by European settlement. Garry oak forms ectomycorrhizas that are essential to its existence and will likely play an important role in the response of this tree to climate change. Yet, relatively little is known about the ectomycorrhizal fungi associated with Garry oak in BC. In this study, we have documented the occurrence of fungi forming ectomycorrhizas with Garry oak at six locations on Vancouver Island by sequencing the internal transcribed spacer region of ectomycorrhizal root tips collected from Garry oak stands. Of the 47 species we detected, only about 20% can be confidently assigned to known species because not all species have been sequenced and many sequences in public databases are incorrectly or incompletely identified, but the majority of them belong to a community of fungi associated primarily with oaks or other members of Fagaceae. The uniqueness of this community of ectomycorrhizal fungi indicates that the possible expansion of the range of Garry oak in BC in response to climate change may be limited by the co-migration of its ectomycorrhizal fungi.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,130
Score d'incertitude au seuil0,262

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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