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Enregistrement W4378905886 · doi:10.3390/ijms24119476

Investigating the Theranostic Potential of Graphene Quantum Dots in Alzheimer’s Disease

2023· article· en· W4378905886 sur OpenAlexafffund
Max Walton-Raaby, R. Jeremy Woods, Subha Kalyaanamoorthy

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesAlliance de recherche numérique du CanadaCanada First Research Excellence Fund
Mots-clésTau proteinChemistryBinding siteQuantum dotMonomerGrapheneBiophysicsAlzheimer's diseaseNanotechnologyBiochemistryDiseaseMaterials scienceBiologyMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alzheimer’s disease (AD) is one of the leading causes of death worldwide, with no definitive diagnosis or known cure. The aggregation of Tau protein into neurofibrillary tangles (NFTs), which contain straight filaments (SFs) and paired helical filaments (PHFs), is a major hallmark of AD. Graphene quantum dots (GQDs) are a type of nanomaterial that combat many of the small-molecule therapeutic challenges in AD and have shown promise in similar pathologies. In this study, two sizes of GQDs, GQD7 and GQD28, were docked to various forms of Tau monomers, SFs, and PHFs. From the favorable docked poses, we simulated each system for at least 300 ns and calculated the free energies of binding. We observed a clear preference for GQD28 in the PHF6 (306VQIVYK311) pathological hexapeptide region of monomeric Tau, while GQD7 targeted both the PHF6 and PHF6* (275VQIINK280) pathological hexapeptide regions. In SFs, GQD28 had a high affinity for a binding site that is available in AD but not in other common tauopathies, while GQD7 behaved promiscuously. In PHFs, GQD28 interacted strongly near the protofibril interface at the putative disaggregation site for epigallocatechin-3-gallate, and GQD7 largely interacted with PHF6. Our analyses revealed several key GQD binding sites that may be used for detecting, preventing, and disassembling the Tau aggregates in AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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