m6A reader proteins: the executive factors in modulating viral replication and host immune response
Notice bibliographique
Résumé
N6-Methyladenosine (m6A) modification is the most abundant covalent modification of RNA. It is a reversible and dynamic process induced by various cellular stresses including viral infection. Many m6A methylations have been discovered, including on the genome of RNA viruses and on RNA transcripts of DNA viruses, and these methylations play a positive or negative role on the viral life cycle depending on the viral species. The m6A machinery, including the writer, eraser, and reader proteins, achieves its gene regulatory role by functioning in an orchestrated manner. Notably, data suggest that the biological effects of m6A on target mRNAs predominantly depend on the recognition and binding of different m6A readers. These readers include, but are not limited to, the YT521-B homology (YTH) domain family, heterogeneous nuclear ribonucleoproteins (HNRNPs), insulin-like growth factor 2 mRNA-binding proteins (IGF2BPs), and many others discovered recently. Indeed, m6A readers have been recognized not only as regulators of RNA metabolism but also as participants in a variety of biological processes, although some of these reported roles are still controversial. Here, we will summarize the recent advances in the discovery, classification, and functional characterization of m6A reader proteins, particularly focusing on their roles and mechanisms of action in RNA metabolism, gene expression, and viral replication. In addition, we also briefly discuss the m6A-associated host immune responses in viral infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».