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Enregistrement W4378952802 · doi:10.1111/vox.13444

Monitoring viral genomic sequences in transfusion‐transmitted viruses

2023· article· en· W4378952802 sur OpenAlexaff
Daniel Candotti, Steven J. Drews, Helen M. Faddy

Notice bibliographique

RevueVox Sanguinis · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesUniversity of the Sunshine Coast
Mots-clésPublic healthSanger sequencingGenomic sequencingBlood transfusionTransmission (telecommunications)MedicineVirologyDNA sequencingBiologyImmunologyGenomePathologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVES: Monitoring genomic sequences of blood-borne viruses infecting blood donors enables blood operators to undertake molecular epidemiology, confirm transfusion transmission and assess and characterize molecular and serological screening assays. The purpose of the study was to determine how blood operators globally value viral diversity surveillance and to assess its impact. MATERIALS AND METHODS: An electronic questionnaire was developed and circulated to members of the International Society of Blood Transfusion-transmitted infectious diseases working party. Responses were compiled and complete data sets were analysed. RESULTS: Ninety-seven percent of respondents agreed that monitoring viral genomic sequences was important to blood operators and the transfusion community. However, only 47% of respondents are currently doing this monitoring. The main limitations reported were a lack of financial resources and expertise. Sequencing techniques, primarily next-generation sequencing and also Sanger sequencing, were considered most appropriate, with the preferred option for testing being regional or national reference centres. Respondents agreed that engagement with public health authorities needs to be enhanced. CONCLUSION: Monitoring genomic sequences of blood-borne viruses is widely considered important by the transfusion community because of its direct applications for transfusion safety, and beyond for public health in general. Therefore, there is a need to strengthen collaboration between blood operators and public health authorities. While national and regional reference centres may be the most appropriate structure for such testing, international collaborations should not be overlooked. Overcoming financial barriers will be an important hurdle for many.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,445
Score d'incertitude au seuil0,599

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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