Drug-selective pressure effect on HIV integrase mutations in antiretroviral naïve and experienced patients
Notice bibliographique
Résumé
Introduction:Resistance to antiretroviral drugs is a serious problem often related to selective druginduced pressure and sub-optimal drug dosing.This study aimed to investigate drug resistance-associated mutations in human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) integrase gene caused by the drug pressure of reverse transcriptase inhibitors (RTIs) and protease inhibitors (PIs).Material and methods: For this purpose, RNA of 50 HIV-infected patients (25 drug-naïve patients and 25 patients under antiretroviral therapy [INI naive]) was extracted and one step RT-nested PCR was carried out on HIV integrase (IN).Then, gene sequences were analyzed to determine sub-types and antiretroviral resistance-associated mutations (RAMs).Results: Phylogenetic analysis revealed that recombinant sub-type CRF35-AD was the most prevalent in all patients (87.2%), followed by A1 sub-type (12.8%).Among the 25 ART-experienced patients, two mutations (N155I, G163R) associated with resistance to integrase inhibitors (INI) were found.Among the 25 naïve patients, several polymorphisms were observed, which was also lower in this group than in the ART group. Conclusions:The results of this study indicated that the integrase mutations can be caused by the effect of selective pressure induced by antiviral agents, such as RTIs and PIs.Therefore, examination of the integrase drug resistance mutations is recommended before starting treatment in Iran.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».