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Enregistrement W4379056381 · doi:10.1016/j.isci.2023.106893

Expanded male sex-determining region conserved during the evolution of homothallism in the green alga Volvox

2023· article· en· W4379056381 sur OpenAlexfundno aff
Kayoko Yamamoto, Ryo Matsuzaki, Wuttipong Mahakham, Wirawan Heman, Hiroyuki Sekimoto, Masanobu Kawachi, Yohei Minakuchi, Atsushi Toyoda, Hisayoshi Nozaki

Notice bibliographique

RevueiScience · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Institute of GeneticsMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyJapan Society for the Promotion of ScienceJapan Society for the Promotion of Science London
Mots-clésHeterothallicHomothallismBiologyEvolution of sexual reproductionSexual reproductionAncestorEvolutionary biologyPloidyLineage (genetic)Brown algaeGeneticsAlgaeBotanyGeneMating type

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Male and female genotypes in heterothallic (self-incompatible) species of haploid organisms, such as algae and bryophytes, are generally determined by male and female sex-determining regions (SDRs) in the sex chromosomes. To resolve the molecular genetic basis for the evolution of homothallic (bisexual and self-compatible) species from a heterothallic ancestor, we compared whole-genome data from Thai and Japanese genotypes within the homothallic green alga Volvox africanus . The Thai and Japanese algae harbored expanded ancestral male and female SDRs of ∼1 Mbp each, representing a direct heterothallic ancestor. Therefore, the expanded male and female ancestral SDRs may originate from the ancient (∼75 mya) heterothallic ancestor, and either might have been conserved during the evolution of each homothallic genotype. An expanded SDR-like region seems essential for homothallic sexual reproduction in V. africanus , irrespective of male or female origin. Our study stimulates future studies to elucidate the biological significance of such expanded genomic regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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