The Global Spread Pattern of Rat Lungworm Based on Mitochondrial Genetics
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Eosinophilic meningitis due to rat lungworm, Angiostrongylus cantonensis, is a global public health concern. Human cases and outbreaks have occurred in the new endemic areas, including South America and Spain. The growing genetic data of A. cantonensis provides a unique opportunity to explore the global spread pattern of the parasite. Eight more mitochondrial (mt) genomes were sequenced by the present study. The phylogeny of A. cantonensis by Bayesian inference showed six clades (I–VI) determined by network analysis. A total of 554 mt genomes or fragments, which represented 1472 specimens of rat lungworms globally, were used in the present study. We characterized the gene types by mapping a variety of mt gene fragments to the known complete mt genomes. Six more clades (I2, II2, III2, V2, VII and VIII) were determined by network analysis in the phylogenies of cox1 and cytb genes. The global distribution of gene types was visualized. It was found that the haplotype diversity of A. cantonensis in Southeast and East Asia was significantly higher than that in other regions. The majority (78/81) of samples beyond Southeast and East Asia belongs to Clade II. The new world showed a higher diversity of Clade II in contrast with the Pacific. We speculate that rat lungworm was introduced from Southeast Asia rather than the Pacific. Therefore, systematic research should be conducted on rat lungworm at a global level in order to reveal the scenarios of spread.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle