A systematic review of gut microbiota profile in <scp>COVID</scp>‐19 patients and among those who have recovered from <scp>COVID</scp>‐19
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Given the scale and persistence of coronavirus disease 2019 (COVID-19), significant attention has been devoted to understanding the relationship between human gut microbiota and COVID-19. In this systematic review we aimed to comprehensively assess the gut microbiota composition in patients infected with COVID-19 and those recovered from COVID-19 in comparison to healthy controls (HCs). METHODS: Peer-reviewed articles and preprints published up to September 1, 2022, were searched in Ovid MEDLINE, Ovid EMBASE, and SCOPUS. Observational studies reporting the gut microbiota profile in adult (≥18 years) COVID-19 patients or those recovered from COVID-19 compared to HCs were eligible for inclusion in this systematic review. The quality assessment of studies was performed using the Newcastle-Ottawa scale. RESULTS: We identified 27 studies comprising 18 studies that compared COVID-19 patients and six that compared recovered COVID-19 patients to HCs, while the other three studies compared both COVID-19 and recovered COVID-19 patients to HCs. Compared to HCs, decreased gut microbial diversity and richness and a distinctive microbial composition were reported in COVID-19 patients and recovered COVID-19 patients. In COVID-19 patients, Bacteroidetes were found to be enriched, and Firmicutes depleted. Decreased short-chain fatty acid (SCFA)-producing bacteria, such as Faecalibacterium, Ruminococcus, and Bifidobacterium, among others, were also observed in COVID-19 patients, which were not restored to normal levels in those who recovered. CONCLUSION: Gut dysbiosis was evident in COVID-19, and available data suggested that dysbiosis persisted even in recovered COVID-19 patients, with decreased Firmicutes and SCFA-producing bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,013 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».