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Enregistrement W4379228856 · doi:10.1101/2023.05.29.23290580

Genetic inhibition of angiopoietin-like protein-3, lipoprotein-lipid levels and cardiometabolic diseases

2023· preprint· en· W4379228856 sur OpenAlexafffund
Émilie Gobeil, Jérôme Bourgault, Patricia L. Mitchell, Ursula Houessou, Éloi Gagnon, Arnaud Girard, Audrey Paulin, Hasanga D. Manikpurage, Christian Couture, Simon Marceau, Yohan Bossé, Sébastien Thériault, Patrick Mathieu, Marie‐Claude Vohl, André Tchernof, Benoît J. Arsenault

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipid metabolism and disorders
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesNIH Office of the DirectorFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université LavalNational Institutes of HealthPfizerSilence TherapeuticsCommon FundBausch HealthNovo NordiskIonis Pharmaceuticals
Mots-clésMendelian randomizationPCSK9Internal medicineApolipoprotein BMedicineEndocrinologySingle-nucleotide polymorphismTriglycerideMicrosomal triglyceride transfer proteinLipoproteinType 2 diabetesBiologyCholesterolDiabetes mellitusVery low-density lipoproteinGeneGeneticsGenetic variantsGenotypeLDL receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background RNA-based, antibody-based and gene editing-based therapies are currently under investigation to determine if the inhibition of angiopoietin-like protein-3 (ANGPTL3) could reduce lipoprotein-lipid levels and atherosclerotic cardiovascular diseases (ASCVD) risk. We used Mendelian randomization (MR) to determine whether genetic variations influencing ANGPTL3 liver gene expression, blood levels and protein structure could causally influence triglyceride and apolipoprotein B (apoB) levels as well as coronary artery disease (CAD), ischemic stroke (IS) and other cardiometabolic diseases. Methods We performed RNA-sequencing of 246 explanted liver samples to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with liver expression of ANGPTL3 . We used genome-wide summary statistics of plasma protein levels of ANGPTL3 from the deCODE study (n=35,359). We also identified 647 carriers of ANGPTL3 protein-truncating variants (PTVs) associated with lower plasma triglyceride levels in the UK Biobank. We performed two-sample MR using SNPs that influence ANGPTPL3 liver expression or ANGPTPL3 plasma protein levels as exposure and cardiometabolic diseases as outcomes (CAD, IS, heart failure, non-alcoholic fatty liver disease, acute pancreatitis and type 2 diabetes). The impact of rare PTVs influencing plasma triglyceride levels on apoB levels and CAD was also investigated in the UK Biobank. Results In two-sample MR studies, common genetic variants influencing ANGPTL3 hepatic or blood expression levels of ANGPTL3 had a very strong effect on plasma triglyceride levels, a more modest effect on LDL cholesterol, a weaker effect on apoB levels and no effect on CAD or other cardiometabolic diseases. In the UK Biobank, carriers of rare ANGPTL3 PTVs providing lifelong reductions in median plasma triglyceride levels (-0.37 [interquartile range=0.41] mmol/L) had slightly lower apoB levels (-0.06±0.32] g/L) and similar CAD event rate compared to noncarriers (10.2% versus 10.9% in carriers versus noncarriers, p=0.60). Conclusions PTVs influencing ANGPTL3 protein structure as well as common genetic variants influencing ANGPTL3 hepatic expression and/or blood protein levels exhibit a strong effect on circulating plasma triglyceride levels, a weak effect on circulating apoB levels and no effect on ASCVD. Near-complete inhibition of ANGPTL3 function in patients with very elevated apoB levels will likely be required to reduce ASCVD risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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