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Enregistrement W4379281274 · doi:10.1200/jco.2023.41.16_suppl.e21065

Prognostic effects of <i>TP53</i> variants co-occuring in patients with <i>HER2</i>-mutated non-small cell lung cancer (NSCLC).

2023· article· en· W4379281274 sur OpenAlexaff
Jamie Feng, Katrina Hueniken, Zhen Fan, Lucy Corke, Natasha B. Leighl, Geoffrey Liu, Penelope Ann Bradbury, Adrian G. Sacher, Lawson Eng, Tracy Stockley, Ming‐Sound Tsao, Frances A. Shepherd

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInternal medicineCohortOncologyLung cancerProportional hazards modelProgression-free survivalAdenocarcinomaStage (stratigraphy)CancerOverall survivalGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e21065 Background: TP53 variants are common in NSCLC and have been reported as prognostic of poor outcome. The impact of TP53 variants in ERBB2/HER2-mutated NSCLC is unclear. Methods: A total of 40 patients with HER2-mutated NSCLC at Princess Margaret Cancer Centre were identified retrospectively; next generation sequencing results were reviewed for TP53 variant status. Associations between TP53 status with patient and tumor characteristics, and outcomes (overall survival [OS] and progression-free survival [PFS]), were investigated. Median survival was computed by Kaplan-Meier estimator; differences between groups were assessed via Cox proportional hazards regression. Results: Co-occurring TP53 variants and HER2 mutations were found in 19/40 patients (47.5%). Median age was 64.5 years and most patients were female (65%), never-smokers (74%), and had adenocarcinoma (90%; Table 1). Median OS was 39.3 months (95% CI:31 months – not reached [NR]) in the TP53 wildtype (WT) cohort compared to 20.5 months (95% CI:3.7 months - NR) in the TP53 variant cohort (HR 2.65 (95% CI: 1.09-6.43; p = 0.03). Median PFS was 30.9 months [16.7-59.8] vs 15.9 months [10.2-NR], although not statistically significant (HR 1.86, 95% CI 0.83-4.18; p = 0.13). There was a tendency for presence of brain metastases at any point for those with TP53 variants (38% versus 63%, p = 0.11). Of the 29 de novo stage IV patients, 10 (36%) had first line targeted treatment. The rest had chemoimmunotherapy (29%), chemotherapy (25%) or immunotherapy (11%). Overall response rates were similar to first line palliative treatment (33% vs 38%, p = 1.00). Conclusions: Co-occuring TP53 variants with HER2 mutations are prognostic of shorter OS and PFS in NSCLC, and may be associated with a higher incidence of brain metastases. Our larger validation dataset with ~75 patients will be presented.[Table: see text]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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