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Enregistrement W4379348087 · doi:10.1017/cjn.2023.87

C.1 The molecular diagnostic landscape of children with seizure onset in the first three years of life

2023· article· en· W4379348087 sur OpenAlexaffvenue
Dianalee McKnight, Heather M. McLaughlin, Celene Grayson, Robin Sherrington, Natalie C. Butterfield, Swaroop Aradhya, L DeRienzo, Ana Morales, Andrew T. Willcock, Benjamin K. Johnson

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensBurnaby Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpilepsyPediatricsMedicineAge of onsetInternal medicineDiseasePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: To clarify the landscape of molecular diagnoses (MDs) in early-onset epilepsy individuals, we determined the prevalent MDs stratified by age at seizure onset (SO) and the time to MD in children with SO <36 months of life. Methods: A panel of up to 302 genes associated with epilepsy was utilized and ordering physicians provided the age of SO. Diagnostic yield analyses were performed for SO ages including <1 mo, 1-2 mo, 3-5 mo, 6-11 mo, 12-23 mo, and 24-35 mo. The time to MD (MD age - SO age) was determined for the top 10 genes in each SO category. Results: 15,074 individuals with SO <36 months of life were tested. Predominant MD findings are as follows: KCNQ2 in neonates with SO at <1mo, KCNQ2 and CDKL5 for SO between 1-2 mo, PRRT2 and SCN1A for SO between 3-11 mo, and SCN1A for SO between 12-36 months. The median time to MD varied by gene. For example, there was no delay in the median time to MD for the GLDC, KCNQ2, and SCN2A genes while the median delay for MECP2, SLC2A1, and other genes was ≥ 12 months. Conclusions: These data highlight the importance of comprehensive early testing in children with early-onset epilepsy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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