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Enregistrement W4379375756 · doi:10.7554/elife.84204

Calcium and bicarbonate signaling pathways have pivotal, resonating roles in matching ATP production to demand

2023· article· en· W4379375756 sur OpenAlexfundno aff
Maura Greiser, Mariusz Karbowski, Aaron D. Kaplan, Andrew Kyle Coleman, Nicolas Verhoeven, Carmen A. Mannella, W. Jonathan Lederer, Liron Boyman

Notice bibliographique

RevueeLife · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute on AgingNational Institutes of HealthFrontiers FoundationNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of Maryland, BaltimoreNational Institute of General Medical SciencesAmerican Heart Association
Mots-clésBicarbonateCell biologyMitochondrionBiochemistryBiologyMitochondrial matrixSignal transductionChemistryEnzymeEndocrinologyCytosol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondrial ATP production in ventricular cardiomyocytes must be continually adjusted to rapidly replenish the ATP consumed by the working heart. Two systems are known to be critical in this regulation: mitochondrial matrix Ca 2+ ([Ca 2+ ] m ) and blood flow that is tuned by local cardiomyocyte metabolic signaling. However, these two regulatory systems do not fully account for the physiological range of ATP consumption observed. We report here on the identity, location, and signaling cascade of a third regulatory system -- CO 2 /bicarbonate. CO 2 is generated in the mitochondrial matrix as a metabolic waste product of the oxidation of nutrients. It is a lipid soluble gas that rapidly permeates the inner mitochondrial membrane and produces bicarbonate in a reaction accelerated by carbonic anhydrase. The bicarbonate level is tracked physiologically by a bicarbonate-activated soluble adenylyl cyclase (sAC). Using structural Airyscan super-resolution imaging and functional measurements we find that sAC is primarily inside the mitochondria of ventricular cardiomyocytes where it generates cAMP when activated by bicarbonate. Our data strongly suggest that ATP production in these mitochondria is regulated by this cAMP signaling cascade operating within the inter-membrane space by activating local EPAC1 ( E xchange P rotein directly A ctivated by c AMP) which turns on Rap1 (Ras-related protein-1). Thus, mitochondrial ATP production is increased by bicarbonate-triggered sAC-signaling through Rap1. Additional evidence is presented indicating that the cAMP signaling itself does not occur directly in the matrix. We also show that this third signaling process involving bicarbonate and sAC activates the mitochondrial ATP production machinery by working independently of, yet in conjunction with, [Ca 2+ ] m -dependent ATP production to meet the energy needs of cellular activity in both health and disease. We propose that the bicarbonate and calcium signaling arms function in a resonant or complementary manner to match mitochondrial ATP production to the full range of energy consumption in ventricular cardiomyocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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