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Enregistrement W4379471161 · doi:10.1016/j.cris.2023.100062

Structure of an antennally-expressed carboxylesterase suggests lepidopteran odorant degrading enzymes are broadly tuned

2023· article· en· W4379471161 sur OpenAlexafffund
Jacob A. Corcoran, Cyril Hamiaux, Nicoletta Faraone, Christer Löfstedt, Colm Carraher

Notice bibliographique

RevueCurrent Research in Insect Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensAcadia University
Organismes subventionnairesAgricultural Research ServiceKungliga Fysiografiska Sällskapet i LundVetenskapsrådetSwedish Foundation for International Cooperation in Research and Higher EducationYork UniversityU.S. Department of Agriculture
Mots-clésSex pheromoneCarboxylesterasePheromoneEnzymeBiologyCutinaseInsectBiochemistryGeneOlfactory systemOdorant-binding proteinFunction (biology)Cell biologyGeneticsBotanyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Insects rely on the detection of chemical cues present in the environment to guide their foraging and reproductive behaviour. As such, insects have evolved a sophisticated chemical processing system in their antennae comprised of several types of olfactory proteins. Of these proteins, odorant degrading enzymes are responsible for metabolising the chemical cues within the antennae, thereby maintaining olfactory system function. Members of the carboxyl/cholinesterase gene family are known to degrade odorant molecules with acetate-ester moieties that function as host recognition cues or sex pheromones, however, their specificity for these compounds remains unclear. Here, we evaluate expression levels of this gene family in the light-brown apple moth, Epiphyas postvittana, via RNAseq and identify putative odorant degrading enzymes. We then solve the apo-structure for EposCCE24 by X-ray crystallography to a resolution of 2.43 Å and infer substrate specificity based on structural characteristics of the enzyme's binding pocket. The specificity of EposCCE24 was validated by testing its ability to degrade biologically relevant and non-relevant sex pheromone components and plant volatiles using GC–MS. We found that EposCCE24 is neither capable of discriminating between linear acetate-ester odorant molecules of varying chain length, nor between molecules with varying double bond positions. EposCCE24 efficiently degraded both plant volatiles and sex pheromone components containing acetate-ester functional groups, confirming its role as a broadly-tuned odorant degrading enzyme in the moth olfactory organ.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,202
Tête enseignante GPT0,430
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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