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Enregistrement W4379508670 · doi:10.1007/s11306-023-02016-8

The relative abundance of fecal bacterial species belonging to the Firmicutes and Bacteroidetes phyla is related to plasma levels of bile acids in young adults

2023· article· en· W4379508670 sur OpenAlexaff
Francisco J. Osuna‐Prieto, Huiwen Xu, Lourdes Ortiz-Alvarez, Xinyu Di, Isabelle Köhler, Lucas Jurado‐Fasoli, José Rubio‐López, Julio Plaza‐Díaz, Ramiro Vílchez-Vargas, Alexander Link, Ángel Gil, Jonatan R. Ruiz, Patrick C.N. Rensen, Borja Martínez‐Téllez

Notice bibliographique

RevueMetabolomics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesMinisterio de UniversidadesEuropean Regional Development FundJunta de AndalucíaUniversidad de GranadaMinisterio de Economía y CompetitividadInstituto de Salud Carlos IIIChina Scholarship CouncilFundación Alfonso Martín EscuderoFundación Iberoamericana de NutriciónAstraZeneca HealthCare FoundationAstraZeneca
Mots-clésBacteroidetesFirmicutesPhylumFecesBiologyZoologyAbundance (ecology)Relative species abundanceMicrobiologyBacteriaEcologyGenetics16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Gut bacteria play a crucial role in the metabolism of bile acids (BA). Whether an association exists between the fecal microbiota composition and circulating BA levels in humans is poorly understood. Here, we investigated the relationship between fecal microbiota diversity and composition with plasma levels of BA in young adults. METHODS: Fecal microbiota diversity/composition was analyzed with 16S rRNA sequencing in 80 young adults (74% women; 21.9 ± 2.2 years old). Plasma levels of BA were measured using liquid chromatography-tandem mass spectrometry. PERMANOVA and Spearman correlation analyses were used to investigate the association between fecal microbiota parameters and plasma levels of BA. RESULTS: Fecal microbiota beta (P = 0.025) and alpha diversity indexes of evenness (rho = 0.237, P = 0.033), Shannon (rho = 0.313, P = 0.004), and inverse Simpson (rho = 0.283, P = 0.010) were positively associated with plasma levels of the secondary BA glycolithocholic acid (GLCA). The relative abundance of genera belonging to the Firmicutes and Bacteroidetes phyla was positively correlated with plasma levels of GLCA (all rho ≥ 0.225, P ≤ 0.049). However, the relative abundance of species from Firmicutes and Bacteroidetes phyla were negatively correlated with plasma levels of primary and secondary BA (all rho ≤ - 0.220, P ≤ 0.045), except for the relative abundance of Bacteroides vulgatus, Alistipes onderdonkii, and Bacteroides xylanisolvens species (Bacteroidetes phylum) that were positively correlated with the plasma levels of GLCA. CONCLUSIONS: The relative abundance of specific fecal bacteria species is associated with plasma levels of BA in young adults. However, further investigations are required to validate whether the composition of the gut microbiota can regulate the plasma concentrations of BA in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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