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Enregistrement W4379534666 · doi:10.3389/ffgc.2023.1172889

First report of Melampsora epitea causing stem cankers on Salix pentandra in Alberta, Canada

2023· article· en· W4379534666 sur OpenAlexafffundabout
Tod D. Ramsfield, Nicolas Feau, Philippe Tanguay, Richard C. Hamelin, Padmini Herath, Toso Bozic

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Forests and Global Change · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBioenergy crop production and management
Établissements canadiensNatural Resources CanadaUniversity of British ColumbiaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesCanadian Forest ServiceU.S. Forest ServiceInstitut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'EnvironnementUniversità degli Studi di FirenzeGenome Canada
Mots-clésHerbariumWillowInternal transcribed spacerBiologyBotanyPhylogenetic tree

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In June, 2021, laurel willow (Salix pentandra) near Slave Lake, Alberta, was found to be infected by a Melampsora sp. that produced bright yellow urediniospores in uredia that were present on catkins, leaves, and stems. All Melampsora species previously reported in Canada are recorded as infecting leaves; therefore, further investigation was undertaken to ascertain the identity of this pathogen. To assess the relationship between this specimen and other Melampsora spp. previously collected from Canada, samples of willow leaves infected by Melampsora spp. were sourced from mycological herbariums located at the Laurentian Forestry Centre (QFB) and the Northern Forestry Centre (CFB, WINF(M)). DNA sequence data from the internal transcribed spacer (ITS) ribosomal RNA region of the fresh specimen, herbarium specimens, and DNA sequence data deposited within GenBank, were used to conduct a phylogenetic analysis. Sequencing and BLAST analysis of the material from the sample resulted in a 99.3% sequence identity match to Melampsora epitea “Mel J” collected from Larix laricina in New York State. The ITS sequence from the herbarium sample WINF(M)7356 (described as M. abieti-capraearum from Manitoba) had 100.0% identity with the Alberta sample. Additionally, specimens WINF(M)11892 (Melampsora sp. from Manitoba) and CFB8931 (Melampsora sp. from the Yukon) had 99.0% sequence identity with the Alberta sample. From these results we applied the identity of M. epitea to the rust discovered in Slave Lake, AB. With the current emphasis on willows for bioenergy production in Canada, growers must remain vigilant for this pathogen and the damages it could cause to willow plantations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil0,136

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0040,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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