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Enregistrement W4379599972 · doi:10.20892/j.issn.2095-3941.2022.0635

Associations between polymorphisms in leptin and leptin receptor genes and colorectal cancer survival

2023· article· en· W4379599972 sur OpenAlexafffundabout
Meizhi Du, Yu Wang, Jillian Vallis, Matin Shariati, Patrick S. Parfrey, John McLaughlin, Peter Wang, Yun Zhu

Notice bibliographique

RevueCancer Biology and Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueRegulation of Appetite and Obesity
Établissements canadiensBeatrice Hunter Cancer Research InstitutePublic Health OntarioUniversity of TorontoMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésColorectal cancerLeptin receptorMedicineLeptinSingle-nucleotide polymorphismInternal medicineAdipokineGenotypingOncologyObesityProportional hazards modelGenotypeCancerGeneBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Leptin (LEP) is an obesity-associated adipokine associated with tumor cell growth. We examined the relevance of genetic variants of LEP and leptin receptor (LEPR) to colorectal cancer (CRC) survival by using data from the Newfoundland Familial Colorectal Cancer Study. Methods: A total of 532 patients newly diagnosed with CRC between 1997 and 2003 were followed up until April 2010. Data on their demographics and lifestyles were collected via questionnaires. Genotyping of blood samples was performed with the Illumina Human Omni-Quad Bead chip. Multivariable Cox models were used to assess the relationships of 35 tag single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in LEP and LEPR with overall survival (OS), disease-free survival (DFS), and CRC-specific survival. Results: At the gene level, LEP was associated with DFS (P = 0.017), and LEPR was associated with both DFS (P = 0.021) and CRC-specific survival (P = 0.013) in patients with CRC. In single-SNP analysis, LEP rs11763517, LEPR rs9436301, and LEPR rs7602 were associated with DFS after adjustment for multiple testing. The LEPR haplotypes G-C-T (rs7534511-rs9436301-rs1887285) and A-A-G (rs7602-rs970467-rs9436748) were associated with prolonged OS among patients with CRC overall (G-C-T: HR, 0.63; 95% CI, 0.43–0.93; A-A-G: HR, 0.59; 95% CI, 0.38–0.91) and those diagnosed with colon cancer (G-C-T: HR, 0.54; 95% CI, 0.34–0.86; A-A-G: HR, 0.49; 95% CI, 0.29–0.83). Similar results were observed for DFS. Moreover, significant interactions were found among LEPR rs7602 (A vs. G), LEPR rs1171278 (T vs. C), red meat intake, and BMI status: the associations between these variants and prolonged DFS were limited to patients with below-median red meat consumption and body mass index (BMI) < 25 kg/m2. Conclusions: Polymorphic variations in the LEP and LEPR genes were associated with survival of patients after CRC diagnosis. The LEP/LEPR-CRC survival association was modified by participants’ red meat intake and BMI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,230
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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