Association of Neighborhood Deprivation and Depressive Symptoms With Epigenetic Age Acceleration: Evidence From the Canadian Longitudinal Study on Aging
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Neighborhood deprivation and depression have been linked to epigenetic age acceleration. The next-generation epigenetic clocks including the DNA methylation (DNAm) GrimAge, and PhenoAge have incorporated clinical biomarkers of physiological dysregulation by selecting cytosine-phosphate-guanine sites that are associated with risk factors for disease, and have shown improved accuracy in predicting morbidity and time-to-mortality compared to the first-generation clocks. The aim of this study is to examine the association between neighborhood deprivation and DNAm GrimAge and PhenoAge acceleration in adults, and assess interaction with depressive symptoms. METHODS: The Canadian Longitudinal Study on Aging recruited 51 338 participants aged 45-85 years across provinces in Canada. This cross-sectional analysis is based on a subsample of 1 445 participants at baseline (2011-2015) for whom epigenetic data were available. Epigenetic age acceleration (years) was assessed using the DNAm GrimAge and PhenoAge, and measured as residuals from regression of the biological age on chronological age. RESULTS: A greater neighborhood material and/or social deprivation compared to lower deprivation (b = 0.66; 95% confidence interval [CI] = 0.21, 1.12) and depressive symptoms scores (b = 0.07; 95% CI = 0.01, 0.13) were associated with higher DNAm GrimAge acceleration. The regression estimates for these associations were higher but not statistically significant when epigenetic age acceleration was estimated using DNAm PhenoAge. There was no evidence of a statistical interaction between neighborhood deprivation and depressive symptoms. CONCLUSIONS: Depressive symptoms and neighborhood deprivation are independently associated with premature biological aging. Policies that improve neighborhood environments and address depression in older age may contribute to healthy aging among older adults living in predominantly urban areas.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».